鼻病毒持续存在的转录组学揭示体外鼻上皮细胞中RIG-I和干扰素刺激基因的持续表达
背景：人类鼻病毒(HRVs)经常与哮喘恶化相关，并在哮喘患者的气道中发现。虽然HRV诱导的急性感染已有大量文献记载，但鼻上皮是否会持续HRV感染以及相关的宿主免疫反应激活尚不清楚。
背景：人类鼻病毒(HRVs)经常与哮喘恶化相关，并在哮喘患者的气道中发现。虽然HRV诱导的急性感染已有大量文献记载，但鼻上皮是否会持续HRV感染以及相关的宿主免疫反应激活尚不清楚。
目的：研究HRV持续期间人类鼻上皮细胞(hNECs)的持续调节宿主反应。
方法：通过时间过程研究，使用hNECs的体外感染模型建立了HRV16的持久性和病毒复制的动态。在感染后3天和14天(dpi)，分别对感染早期和后期的hNECs进行RNA测序。使用基因本体论(GO)和Ingenuity通路分析对差异表达基因(DEGs)的功能富集进行了评估。
结果：HRV RNA和蛋白质的表达在整个长期感染过程中持续存在，即使在感染病毒子代产量减少后。对独特的DEGs的GO分析表明，在3dpi时与纤毛功能和气道重塑有关的途径的调节发生了改变，在14dpi时与丝氨酸型内肽酶活性有关。两个时间点之间共有的DEG的功能富集与干扰素(IFN)和细胞质模式识别受体(PRR)信号传导途径有关。对候选基因的持续调控的验证证实了RIG-I的持续表达，并揭示了它在HRV持续期间与干扰素刺激基因(ISG)的密切共调。
结论：在长期感染过程中，HRV RNA的持续存在并不一定表明有活动性感染。RIG-I和ISG在应对病毒RNA持续存在时的持续表达，突出了评估免疫激活宿主因素在活跃的HRV感染期间如何变化以及此后持续的免疫调节的重要性。
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