慢性呼吸系统疾病的抗生素耐药性：从药敏试验到耐药组
文章描述了CRDs处方的抗生素治疗对呼吸道微生物群的影响，从耐药性分析的角度描述并比较了用于呼吸道耐药组分析的技术。
囊性纤维化、重度哮喘、COPD和支气管扩张等慢性呼吸系统疾病(CRDs)与气道黏液清除异常有关，可使肺部疾病反复加重。EUROPEAN RESPIRATORY REVIEW杂志发表了一篇综述，文章描述了CRDs处方的抗生素治疗对呼吸道微生物群的影响，并分析了抗生素类别和治疗持续时间之间的差异。其次，从耐药性分析的角度描述并比较了用于呼吸道耐药组分析的技术。最后，回顾了目前关于CRDs中呼吸道耐药组的知识体系，以揭示耐药组分析在未来抗菌管理策略中的潜力。
研究报道，在进展性CRDs中，使用抗生素可在10年内降低呼吸道微生物组的细菌多样性，超过年龄和肺功能的影响。耐药组分析的发展，即抗生素耐药基因(ARG)的综合分析，使人们能够更好地了解抗生素耐药的机制。ARG通过呼吸道微生物组的传播可在抗生素治疗下的行为及其停药后的恢复能力中发挥作用。因此，分析呼吸道微生物组内的所有ARG，即分析呼吸道耐药组，对于理解抗生素治疗对呼吸道微生物群落的影响似乎是至关重要的。目前已使用不同的方法来探索呼吸道耐药组：靶向方法、基于序列的分析、宏基因组分析和三维建模。
研究已确定了健康个体和COPD、支气管扩张和严重哮喘患者常见的呼吸道核心耐药组。包括β-内酰胺类、二氨基嘧啶类、氟喹诺酮类、大环内酯类、林可霉素类、氯霉素类、氨基糖苷类和四环素类。具有丰富大环内酯类耐药基因的核心耐药组存在是CRDs未来管理的最新和关键发现。
CRDs与用于预防和治疗急性加重发作的抗生素方案相关，可能揭示了抗生素耐药机制在整个肺部细菌群落中的出现。肺部细菌群落是一个复杂的细菌相互作用网络。在耐药性方面，微生物群落相互作用似乎对基因水平转移或耐药酶的递送具有决定性，耐药酶可保护其他种属免受抗生素分子的影响。因此，在CRDs背景下确定细菌对抗生素敏感性的经典技术似乎存在一些局限性。过去几年中，耐药组分析使破译CRDs患者复杂呼吸道微生物组耐药机制的基因成为可能。这为未来预测和管理这些疾病中细菌耐药性的新策略提供了视角，根据呼吸道耐药组实施个性化抗生素治疗成为可能。
原文出处：
Pailhoriès H, Herrmann J-L, Velo-Suarez L, et al. Antibiotic resistance in chronic respiratory diseases: from susceptibility testing to the resistome. Eur Respir Rev 2022; [DOI: 10.1183/16000617.0259-2021].
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