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诱导痰中MMP12 mRNA表达增加与哮喘患者气道嗜酸性炎症相关:来自生物信息学分析和实验验证的证据

作者: AsthmaAlliance 来源: AsthmaAlliance 日期:2021-09-29
导读

         背景:哮喘是世界范围内常见的慢性气道炎症性疾病。诱导痰基因表达谱的研究可能为哮喘提供无创诊断生物标志物和治疗靶点。

关键字:  哮喘 

        背景:哮喘是世界范围内常见的慢性气道炎症性疾病。诱导痰基因表达谱的研究可能为哮喘提供无创诊断生物标志物和治疗靶点。

        目的:探讨MMP12基因在诱导痰中的表达及其与哮喘气道嗜酸性炎症的关系。

        方法:采用R软件、加权基因共表达网络分析(WGCNA)和蛋白相互作用网络构建(PPI)对GSE76262数据集进行分析。用Cytoscape软件(3.8.4版)筛选前10个hub基因。然后,我们通过ROC曲线估计验证了MMP12在另外两个数据集(GSE137268和GSE74075)中的mRNA表达,并通过实时定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)验证了我们的诱导痰样本。最后,我们探讨了MMP12与哮喘嗜酸性粒细胞相关指标的相关性。

        结果:我们通过对GSE76262数据集的表达谱筛选和验证,获得了CCL17、CCL2、CSF1、CCL22、CCR3、CD69、FCGR2B、CD1C、CD1E和MMP12的前10个中心基因。通过对GSE137268和GSE74075数据集的进一步验证,选择MMP12作为候选基因。最后,我们发现MMP12的mRNA表达在哮喘患者诱导痰中显著上调(p <0.05),且与嗜酸性相关指标显著相关(p <0.05). 这些发现表明MMP12可以作为哮喘的诊断生物标志物。

        结论:我们的研究成功地识别并证明,MMP12由于其高表达并与嗜酸性粒细胞相关指标相关,是一种潜在的哮喘诊断生物标志物。本研究结果可为今后哮喘的诊断和治疗提供新的思路。

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