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慢性超敏性肺炎中的呼吸微生物组与特发性肺纤维化不同

作者：小南来源：南山呼吸日期：2021-05-20

导读

研究的基本原理: 慢性超敏性肺炎(CHP)是反复接触和对吸入抗原致敏后出现的疾病。肺微生物组越来越多地与呼吸系统疾病有关，但是迄今为止，尚无研究调查CHP下气道中微生物群落的组成。

研究目标: 为了表征和比较CHP受试者、特发性肺纤维化(IPF)受试者和对照受试者的气道微生物组。

研究方法: 我们前瞻性地招募了CHP诊断者(n = 110)，IPF诊断者(n = 45)和对照组(n = 28)。受试者进行了肺部盥洗并分离了细菌DNA，通过定量PCR进行了定量，并对16S核糖体RNA基因进行了测序，以表征下呼吸道中的细菌群落。

本研究的检测和主要结果: 在CHP和IPF受试者的下呼吸道中，微生物谱存在明显差异。在细菌分类(门级别)的水平上，患有IPF的受试者和患有CHP的受试者的主要菌群包括厚壁菌、拟杆菌、变形杆菌和放线菌。然而在IPF中厚壁菌占主导地位，而同IPF组中变形杆菌的读数百分比显著低于CHP受试者中发现的百分比。在细菌分类(属级别)的水平上，CHP中葡萄球菌的负担增加，而IPF中放线菌和韦荣氏球菌的负担增加。CHP患者的下呼吸道细菌负荷高于对照组，但低于IPF患者。与IPF相比，CHP的细菌负担与生存率之间没有关联。

研究结论: CHP患者下呼吸道的微生物特征与IPF截然不同，尤其是CHP患者的细菌负担无法预测存活率。

研究概览

本研究主题的科学知识

特发性肺纤维化(IPF)中呼吸微生物组的大量研究已经报告了细菌负荷变化，微生物群落，疾病进展和死亡率之间的关联。与IPF相比，慢性超敏性肺炎(CHP)是一种致病性和预后性不同的疾病，但在表型上仍以不可逆的肺实质纤维化破坏为特征。尽管有表型重叠，但没有研究检查患有这些疾病的个体之间的呼吸菌群是否有所不同。

本研究的突破点

尽管CHP和IPF之间存在表型重叠，但是与健康受试者和IPF患者相比，CHP患者下呼吸道的细菌负荷和微生物组成存在明显差异。与IPF患者相比，CHP中的变形杆菌比例增加，而厚壁菌比例降低。在IPF的下气道中始终显示出较高的细菌负担，并与死亡风险增加相关。但是，CHP患者的细菌负担远低于IPF患者，并且与生存率无关。我们的发现表明，肺微生物组中观察到的变化是疾病特异性的，不能简单地反映出肺内纤维化的存在。