染色体不稳定性(Chromosomal instability, CIN)是克隆多样性(clonal diversification)和肿瘤内异质性(intratumor heterogeneity)的驱动因素，提供了有助于肿瘤进展的遗传多样性。据估计，大约80%的实体癌，包括非小细胞肺癌(non–small cell lung cancer, NSCLC)，具有CIN的特征，且可影响肿瘤的生长和治疗反应。然而，CIN与肿瘤进展的分子机制仍不清楚。近日来自英国曼彻斯特大学的Michela Garofalo课题组在Cancer Research上发表题为CKAP2L Promotes Non–Small Cell Lung Cancer Progression through Regulation of Transcription Elongation的文章，证实CKAP2L可以通过转录延伸调控致癌功能，靶向CKAP2L可增强NSCLC患者的治疗反应。

        为了找出与CIN相关的新因子，作者分析了来自TCGA的517例肺腺癌患者的原发肿瘤的基因表达数据，并与59例正常肺样本进行了比较。生物信息学分析发现许多基因在肿瘤样本中显著过表达，与高拷贝数变异和CIN相关，进一步的相关性分析证实了这些基因可能参与CIN。接下来作者利用小规模RNAi筛选实验筛选与CIN和迁移能力均相关的基因，鉴定出细胞骨架相关蛋白2-like (cytoskeleton-associated protein 2-like, CKAP2L)可能作为一种潜在的致癌基因。对人肺腺癌103个样本的组织芯片检测发现，与正常肺组织相比，原发肺腺癌样本和转移性组织中CKAP2L表达水平显著升高。

        进一步作者发现KRAS和MYC可以调控CKAP2L的表达，CKAP2L的表达对于维持(体外和体内)肺癌的增殖和生长是十分重要的，缺失CKAP2L抑制肿瘤生长。

        机制上，通过质谱分析作者发现CKAP2L直接与RNA Pol II相互作用，缺失CKAP2L后RNA合成受到抑制。ChIP-Seq分析显示缺失CKAP2L可以降低RNA Pol II在细胞周期相关等基因上的结合。RNA Pol II的转录周期调节发生在三个阶段:起始、延伸和终止。后续研究证明CKAP2L在RNA Pol II转录延伸的调控中扮演了重要的角色，尤其是参与细胞周期调控和有丝分裂微管细胞骨架组织的基因。

        RNA Pol II的Ser2磷酸化是转录延伸的标志。作者发现敲低CKAP2L降低了RNA Pol II的Ser2磷酸化水平，而不影响Ser5磷酸化水平。已经证实，周期蛋白依赖的激酶CDK9 与周期蛋白T(cyclin T)形成转录延伸因子b (transcription elongation factor b, P-TEFb)，磷酸化RNA Pol II Ser2，以促进转录延伸。但是CKAP2L并不影响CDK9的表达，表明CKAP2L调控RNA Pol II Ser2磷酸化可能与P-TEFb招募无关。此外， CKAP2L缺失显著增加了NSCLC细胞对CDK9抑制剂alvocidib的敏感性，导致细胞增殖显著减少，细胞死亡增加。

        总之，这些发现阐明了CKAP2L(一种参与CIN的蛋白)促进癌症进展的分子机制，并表明抑制其表达可能是解决CIN诱导的肿瘤异质性、肿瘤进展和耐药性的一种新的治疗策略。