结核分枝杆菌突变与耐药
Eur Respir J：解释结核分枝杆菌突变与耐药表型关系的标准化方法！
了解结核分枝杆菌耐药性明确的遗传基础对于加快开发基于基因序列的快速药物敏感试验方法是很有必要的。
近日，呼吸疾病领域权威杂志Eur Respir J上发表了一篇荟萃分析文章。研究人员提取了原始的基因型-表型相关数据，作为一个全面的系统回顾的一部分，来开发一个标准化的分析方法以解释利福平、对异烟肼、氧氟沙星、左氧氟沙星、莫西沙星、丁胺卡那霉素、卡那霉素、卷曲霉素、链霉素、吡嗪酰胺、乙硫异烟胺、丙硫异烟胺耐药相关的基因突变。研究人员计算了耐药突变的频率和分离易感菌株，并结合新的统计指标将突变分类为高、中、最小或不确定的预测耐药性可信度。
研究人员确定了286个与耐药相关的可信等级突变。与表型方法相比，利福平的敏感性(95%可信区间(CI))为90.3%(89.6-90.9%)，而异烟肼为78.2%(77.4-79%)，其特异性分别为96.3%(95.7-96.8%)和94.4%(93.1-95.5%)。二线药物的敏感性有所不同，从卷曲霉素的67.4%(64.1-70.6%)到莫西沙星的88.2%(85.1-90.9%)，其特异性从莫西沙星的90%(87.1-92.5%)到丁胺卡那霉素的99.5%(99-99.8%)。
这项研究提供了一种标准化和全面的解释突变的方法，以作为结核杆菌耐药表型的预测因子。这些数据为分子诊断和新一代测序提供了临床解释，并可能实现耐药结核患者有效的个体化治疗。
原始出处：
Paolo Miotto,et al.A standardised method for interpreting the association between mutations and phenotypic drug resistance in Mycobacterium tuberculosis. Eur Respir J. http://erj.ersjournals.com/content/50/6/1701354
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