近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10的转录组差异研究
近期，中国食品药品检定研究院研究人员发表论文，旨在对近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10进行转录组测序，对比其转录组差异，发现免疫反应相关差异基因，为药物体内活性评价动物选择提供参考。研究指出，通过二代测序方法发现近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10转录组存在显著差异基因。在KEGG通路分析中筛选了一系列与小鼠免疫应答相关的差异基因，为建立小鼠免疫评价模型积累了数据，对药物实验动
近期，中国食品药品检定研究院研究人员发表论文，旨在对近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10进行转录组测序，对比其转录组差异，发现免疫反应相关差异基因，为药物体内活性评价动物选择提供参考。研究指出，通过二代测序方法发现近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10转录组存在显著差异基因。在KEGG通路分析中筛选了一系列与小鼠免疫应答相关的差异基因，为建立小鼠免疫评价模型积累了数据，对药物实验动物体内活性检测分析具有参考意义，为生物制品评价用实验动物的标准化提供技术支撑。该文发表在2016年第02期《药物分析杂志》上。
采用Illumina Hiseq 2000测序平台进行测序，通过短序列分析获取转录本，通过基因功能分类（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库进行测序结果分析。
获得38 553 614个C57BL/6小鼠的原始序列和37 721 318个C57BL/10小鼠的原始序列。获得118 002个转录本，注释了46 193个差异基因。38 106个转录本注释到2 196个GO分类中，GO分类主要分为3类：细胞成分，分子功能和生物过程。1 600个转录本注释到254个KEGG通路中。另外，发现了4 651个单核苷酸（SNP）位点。
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