木脂素类化合物中组蛋白去乙酰化酶抑制剂的虚拟筛选
作者：小田整理 来源： 日期：2016-03-30
导读
近期，重庆理工大学邸珂等研究了木脂素类化合物中组蛋白去乙酰化酶抑制剂的虚拟筛选，研究发现，木脂素类化合物具有抑制HDAC的作用;虚拟筛选方法可作为预测天然产物潜在活性的有效手段,为木脂素类化合物新的药理活性研究提供了快捷途径和理论指导。该文章发表于2016年04期《中国药房》上。 该研究旨在虚拟筛选具有组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制作用的木脂素类化合物。 研究者们以木酯素Lignanoid为关
近期，重庆理工大学邸珂等研究了木脂素类化合物中组蛋白去乙酰化酶抑制剂的虚拟筛选，研究发现，木脂素类化合物具有抑制HDAC的作用;虚拟筛选方法可作为预测天然产物潜在活性的有效手段,为木脂素类化合物新的药理活性研究提供了快捷途径和理论指导。该文章发表于2016年04期《中国药房》上。
该研究旨在虚拟筛选具有组蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制作用的木脂素类化合物。
研究者们以"木酯素""Lignanoid"为关键词,查询中国知网、维普、Pub Med等中外文数据库中相关文献,收集木脂素类化合物作为配体构建配体库,从蛋白质晶体数据库(PDB)中选取两个HDAC受体HDAC2(PDB code:4LXZ)和HDAC8(PDB code:1T69),运用SYBYL-X 2.0软件将配体和受体三维结构的活性位点进行对接,用总得分来反映配体与受体的亲和力大小。
结果显示，将收集的345个木质素类化合物与4LXZ、1T69原配体一起构建了有347种配体的配体库,其中编号为275、271、110、200、056、258、181、129、037、270、187的配体与HDAC2和HDAC8受体有较好的亲和力,配体与受体的残基以氢键的方式结合。
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