2个产地红景天rDNA-ITS序列及亲缘关系分析
作者：杨艳辉 整理 来源： 日期：2016-01-11
导读
近期，山西大学应用化学研究所研究人员发表论文，旨在对我国2个主产区的主要红景天（RhodiolaL.）品种rDNA-内转录间隔区（ITS）序列进行分析，为红景天种质资源的分子鉴别及进化关系提供依据。研究指出，rDNA-ITS序列是鉴别红景天品种，研究遗传关系的良好方法。该文发表在2015年第09期《药物分析杂志》上。 提取核基因组DNA，聚合酶链反应（PCR）克隆ITS序列；经DNAst
近期，山西大学应用化学研究所研究人员发表论文，旨在对我国2个主产区的主要红景天（Rhodiola L.）品种rDNA-内转录间隔区（ITS）序列进行分析，为红景天种质资源的分子鉴别及进化关系提供依据。研究指出，r DNA-ITS序列是鉴别红景天品种，研究遗传关系的良好方法。该文发表在2015年第09期《药物分析杂志》上。
提取核基因组DNA，聚合酶链反应（PCR）克隆ITS序列；经DNAstar软件拼接序列后，通过Clustal X软件进行比对，考察其变异位点及信息位点；用Mega 4.1计算品种之间的遗传距离，构建最大简约树（maximum parsimony，MP）和邻接树（neighbor-joining，NJ）。
5种红景天材料r DNA-ITS序列长度为603～604 bp，ITS1、5.8 S r DNA和ITS2的DNA长度分别为226 bp、164 bp和213～214 bp。ITS1和ITS2分别含有11和9个变异位点，其中，信息位点分别为6和2个；存在转换、颠换、缺失等现象；5.8 S r DNA序列含7个变异位点，2个信息位点；试验中红景天品种的遗传距离为0.018 2～0.627 3。大花红景天与柴胡红景天亲缘关系最近。
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