miRNA-靶相互作用通过金属调节元件参与锌的成骨信号传导
作者：伊文 来源：MedSci梅斯 日期：2018-12-22
导读
正常的骨骼生长和发育需要足够的锌营养，尽管锌介导的骨骼生长的确切机制仍然定义不明确。由锌激活的关键转录因子是金属反应元件结合转录因子1(MTF-1)，其与金属调节元件(MRE)结合。我们假设：MRE将在miRNA基因的上游以及以下骨生长和发育信号传导通路中的miRNA靶基因上发现：TGF-β，MAPK和Wnt。R中基于Bioconductor的工作流程旨在识别MRE，miRNA和靶基因之间的相互作用。
正常的骨骼生长和发育需要足够的锌营养，尽管锌介导的骨骼生长的确切机制仍然定义不明确。由锌激活的关键转录因子是金属反应元件结合转录因子1(MTF-1)，其与金属调节元件(MRE)结合。我们假设：MRE将在miRNA基因的上游以及以下骨生长和发育信号传导通路中的miRNA靶基因上发现：TGF-β，MAPK和Wnt。R中基于Bioconductor的工作流程旨在识别MRE，miRNA和靶基因之间的相互作用。
在64个成熟miRNA的上游发现MRE序列，其与213个在其自身启动子区域中具有MRE序列的基因相互作用。MAPK1在TGF-β和MAPK信号通路中表现出最多的miRNA-靶相互作用(MTI); CCND2在Wnt信号传导通路中表现出最多的相互作用。Hsa-miR-124-3p在TGF-β和MAPK信号通路中表现出最多的MTI; hsa-miR-20b-5p在Wnt信号传导通路中表现出最多的MTI。 MYC和hsa-miR-34a-5p在所有三种信号传导通路之间共享，也形成MTI单元。JUN表现出最多的蛋白质-蛋白质相互作用，其次是MAPK8。
综上所述，该研究结果表明，细胞内锌状态通过锌/MTF-1/MRE复合物对miRNA基因的转录调节在骨生成中起作用。
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