动物源沙门氏菌的分离与鉴定

1范围

        本方法规定了用于动物源沙门氏菌分离与鉴定的方法。

        本方法适用于各种动物中沙门氏菌的分离与鉴定。

2 设备和材料

        除微生物实验室常规灭菌及培养设备外，其它设备和材料如下。

        2.1 冰箱：2℃-4℃和-20℃。

        2.2 恒温培养箱：36℃±1℃和42℃±1℃。

        2.3 电子天平：感量0.1g。

        2.4 显微镜：10×～100×。

        2.5 生物安全柜。

        2.6 恒温水浴锅：37℃～100℃。

        2.7 PCR仪。

        2.8 电泳仪。

        2.9 电泳凝胶成像分析系统(或紫外透射仪)。

        2.10 冷冻离心机。

        2.11 采样管或商品化采样拭子。

        2.12 小型离心管。

        2.13 微量加样器：1μL～1000μL。

        2.14 吸头(与微量加样器匹配)。

        2.15 漩涡仪。

        2.16 微波炉。

3 培养基和试剂

        3.1 标准菌株：沙门氏菌CVCC 541

        3.2 DNA Maker

        3.3 Taq DNA 聚合酶

        3.4 dNTP

        3.5 琼脂糖

        3.6 5×TBE缓冲液

        三羟甲基氨基甲烷(Tris) 54.0g

        硼酸 27.5g

        0.5M EDTA(pH8.0) 20mL

        加纯净水至 1000mL

        3.7 50×TAEbuffer

        三羟甲基氨基甲烷(Tris)242g

        NA2EDTA.2H2O 37.2g

        醋酸 57.1ml

        加纯净水至 1000mL

        3.8 invA基因引物

        上游为5′-GTG AAA TTA TCG CCA CGT TCG GGC AA-3′

        下游为5′-TCA TCG CAC CGT CAA AGG AAC C -3′

        3.9 运送培养基。

        3.11 沙门氏菌显色琼脂。

        3.12 沙门氏菌阳性血清。

        3.13 亚硒酸盐胱氨酸增菌液(SC)。

        3.14 四硫磺酸盐增菌液(TTB)。

        3.15 核酸染料。

        3.16 氯化钠。

4 沙门氏菌分离与鉴定程序

        沙门氏菌分离与鉴定程序见图2。

        图2 沙门氏菌的分离和鉴定程序

5.操作步骤

5.1 采样

        选择养殖场或屠宰场，用灭菌棉拭子采集动物肠道或泄殖腔(肛门)样品，置入运送培养基中，保存时间不超过48小时。

5.2 沙门氏菌的分离

        5.2.1 将拭子置于SC增菌液，36±1℃培养18-24h 或TTB增菌液，42±1℃培养22-24h。

        5.2.2 将菌液混匀，接种沙门氏菌显色培养基，36±1℃培养22-24h。

        5.2.3 挑取沙门氏菌显色培养基上紫色可疑菌落，接种营养琼脂平板，36±1℃培养16-24h，待进一步细菌鉴定。

5.3 沙门氏菌的鉴定

        5.3.1 生化鉴定

        对于已纯化的菌落，可使用微生物生化鉴定系统或者生化拭条进行生化鉴定，或者通过5.3.2的方法进行分子生物学(PCR)鉴定。

        必要时，用沙门氏菌标准血清进行血清型鉴定。

        5.3.2 PCR法鉴定

        5.3.2.1 PCR模板的制备

        用接种环从营养琼脂上挑选16-24h的纯培养物，置于0.5mL灭菌生理盐水中，12000r/min离心2min，弃上清。再加0.5mL灭菌水，悬浮并涡旋混匀，100℃沸水中煮沸10min后，移至冰上，冷却后以12000r/min离心2min，取上清液为PCR模板。

        5.3.2.2 PCR反应体系的配制

        根据不同厂家PCR试剂用量，配制PCR反应体系，扩增片段长度约284 bp。

        5.3.2.3 PCR反应条件

        95℃预变性5min，94ºC变性30s, 64ºC退火30s，72ºC延伸30s, 30个循环，最后72ºC延伸10min，同时设立阴性和阳性对照。

        5.3.2.4 电泳

        5.3.2.4.1 1.2%琼脂糖凝胶板的制备

        称取1.2g琼脂糖，加入100mL0.5×TBE(或1×TAE)缓冲液中，加入核酸染料，依据样品数选用适宜的梳子，琼脂糖溶化后混匀倒入在水平台面上的凝胶盘中，胶板厚5mm左右。待凝胶冷却凝固后拔出梳子，取出胶块放入电泳槽中，加0.5×TBE(或1×TAE)缓冲液淹没胶面。

        5.3.2.4.2 加样

        取10µLPCR扩增产物和3µL上样缓冲液混匀后加入加样孔，每次电泳时，各做一个阳性对照和阴性对照。

        5.3.2.4.3 电泳条件

        电压110V，电泳时间30min。

        5.3.2.5 结果判定

        电泳结束后，取出胶块置于紫外投射仪上打开紫外灯观察或用凝胶成像仪进行成像分析。

        如果某一待检样品扩增产物的条带与沙门氏菌阳性对照的条带在一条直线上，即条带与加样孔的距离相同，而阴性对照无此条带，则该样品分离到的菌株可初步判定为沙门氏菌，必要时可通过测序来进一步确证。

三、动物源金黄色葡萄球菌的分离与鉴定

1 范围

        本标准规定了用于耐药性测定的动物源金黄色葡萄球菌的分离和鉴定方法。

        本标准适用于牛奶、动物组织和上呼吸道中金黄色葡萄球菌的分离和鉴定。

2 设备和材料

        除微生物实验室常规灭菌及培养设备外，其他设备和材料如下：

        2.1 冰箱：0℃-4℃和-20℃。

        2.2 恒温培养箱：36℃±1℃和42℃。

        2.3 显微镜：10×～100×。

        2.4 商品化或自制采样管。

        2.5 无菌离心管

        2.6 离心机。

        2.8 商品化拭条或微生物鉴定仪。

3 培养基和试剂

        3.1 标准菌株：金黄色葡萄球菌ATCC29213

        3.2 显色培养基

        3.3 7.5 %氯化钠肉汤10 %氯化钠胰酪胨大豆肉汤

        3.4 营养肉汤或BHI肉汤

        3.5 营养琼脂

        3.6 新鲜兔血浆或商品用凝固酶试验兔血浆

        3.7 0.3%过氧化氢液

        3.8 0.85%无菌生理盐水

4 金黄色葡萄球菌分离和鉴定程序

        金黄色葡萄球菌分离和鉴定程序见图3。

        图3 金黄色葡萄球菌分离和鉴定程序

5 操作步骤

        5.1 采样

        5.1.1牛奶样品：到已选定的奶牛养殖场，现场采牛奶置入灭菌试管中，0-4℃保存，不超过48h。

        5.1.2扁桃体、发病动物组织和上呼吸道拭子：无菌操作取发病动物组织和上呼吸道拭子，上呼吸道拭子置入灭菌试管中，0-4℃保存不超过48h。

        5.1.3 吸取1mL牛奶样品或将上呼吸道拭子至盛有10mL 7.5%氯化钠肉汤或10 %氯化钠胰酪胨大豆肉汤中，振荡混匀。

        5.2 增菌和分离培养

        5.2.1 将上述样品匀液于36±1 ℃培养18-24 h。金黄色葡萄球菌在7.5%氯化钠肉汤中呈混浊生长。

        5.2.2 将上述培养物，分别划线接种到显色培养基平板上，无菌操作将发病动物组织直接划线， 36±1 ℃培养24-48h。

        5.2.3 挑取可疑菌落。用营养琼脂纯化一代，待进一步细菌鉴定。

        5.3 金黄色葡萄球菌的鉴定

        5.3.1生化鉴定 将在营养琼脂上培养24小时以内的待鉴定细菌，首先进行触酶试验，应为阳性。

        将新鲜纯化、经触酶试验阳性待检细菌单个菌落，悬浮于5mL灭菌生理盐水，按照生化鉴定试条使用说明书操作， 37℃培养18-24h后判读结果。

        5.3.2血浆凝固酶试验法 挑取显色平板上可疑菌落1 个或以上，分别接种到5mL BHI和营养琼脂平板，36±1℃培养18-24h。将在营养琼脂上培养24h以内的待鉴定细菌，首先进行触酶试验，应为阳性。

        新鲜兔血浆制备：称取柠檬酸钠3.8g，加蒸馏水100mL,溶解后过滤，装瓶，121℃高压灭菌15min。取3.8%柠檬酸钠溶液一份，加兔全血四份，混好静置 (或以3000r/min 离心30 min)，使血液细胞下降，即可得血浆。

        取新鲜配置兔血浆0.5 mL，放入小试管中，再加入BHI 培养物0.2-0.3 mL，振荡摇匀，置36±1℃温箱或水浴箱内，每半小时观察一次，观察6 h，如呈现凝固(即将试管倾斜或倒置时，呈现凝块)或凝固体积大于原体积的一半，被判定为阳性结果。同时以血浆凝固酶试验阳性和阴性葡萄球菌菌株的肉汤培养物作为对照。也可用商品化的试剂，按说明书操作，进行血浆凝固酶试验。

四、动物源弯曲杆菌的分离与鉴定

1 范围

        本标准规定了动物源空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的分离鉴定方法。

        本标准适用于粪便拭子和盲肠内容物中空肠弯曲菌和结肠弯曲菌的分离与鉴定。

2 设备和材料

        除微生物实验室常规灭菌与培养设备外，其他设备和材料如下。

        2.1 采样管

        2.2 采样棉拭子

        2.3 生物安全柜

        2.4 恒温培养箱: 25℃±1℃，36℃±1℃，42℃±1℃。

        2.5 恒温水浴锅：37℃～100℃。

        2.6 微需氧条件：5%氧气+10%二氧化碳+85%氮气，或商品化微需氧包。

        2.7 显微镜：10×～100×。

        2.8 微生物生化鉴定系统或者生化鉴定拭条

        2.9 高速冷冻离心机：≥12000r/min。

        2.10 小型离心管：1.5mL。

        2.11 微量加样器：1μL～1000μL。

        2.12 吸头(与微量加样器相匹配)

        2.13 PCR仪

        2.14 微波炉

        2.15 电泳仪

        2.16 电泳凝胶成像分析系统(或紫外透射仪)

3、培养基和试剂

        3.1 质控菌株：空肠弯曲杆菌标准菌株(ATCC 33560)

        3.2 DNA Marker

        3.3 引物及扩增片段长度

        3.3.1 引物

        空肠弯曲菌：上游 5’ CAT CTT CCC TAG TCA AGC CT 3’，下游 5’AAG ATA TGG CAC TAG CAA GAC 3’，扩增片段长度为 773bp。

        结肠弯曲杆菌：上游：AGG CAA GGG AGC CTT TAA TC，下游：TAT CCC TAT CTA CAA ATT CGCTAT CCC TAT CTA CAA ATT CGC，扩增片段长度为364bp。

        3.4 运送培养基

        3.5 弯曲菌选择性(CCD)培养基

        3.6 哥伦比亚血琼脂培养基

        3.7 生理盐水

        3.8 10 ×PCR 缓冲溶液Ⅱ

        3.9 氯化镁溶液(25mM)

        3.10 Taq 聚合酶(0.5U/μL)

        3.11 dNTPs(2mM)

        3.12 琼脂糖

        3.13 50×TAE缓冲液：将242gTris碱，57.1mL冰乙酸，100mL0.5M EDTA(pH8.0)，加纯水至1000mL。

        1×TAE缓冲液： 临用时将50×TAE缓冲液1份加蒸馏水49份，混匀即可。

        3.14 上样缓冲液

        3.15 溴化乙锭溶液(10mg/mL)：称取1g溴化乙锭溶于100mL水中，用磁力搅拌器搅拌数小时直至完全溶解，避光冷藏(4℃)保存。

        3.16 矿物油

4 空肠弯曲杆菌和结肠弯曲杆菌的分离与鉴定程序

        空肠弯曲杆菌和结肠弯曲杆菌的分离与鉴定程序见图4。

        图4 弯曲杆菌的分离和鉴定程序

5 操作步骤

        5.1 分离与纯化

        5.1.1 分离

        将新鲜或者运送培养基中的粪便拭子或盲肠内容物在CCD培养基上涂抹，用经火焰灭菌并冷却的接种环与涂抹处垂直划线。

        5.1.2 培养

        将上述接种后的平板置于42℃±1℃恒温培养箱中，在微需氧条件下培养24h-48h。

        5.1.3 纯化

        观察24h培养与48h培养的琼脂平板上的菌落形态。挑取灰色、湿润、凸起、光滑圆润、边缘整齐的可疑单菌落，按3.2的培养条件培养纯化。

        5.2鉴定

        5.2.1生化鉴定

        对于已纯化的菌落，可使用微生物生化鉴定系统或者生化拭条进行生化鉴定，并进行结果判定。或者通过5.1-5.4的试验进行分子生物学(PCR)鉴定。

        5.2.2 分子生物学(PCR)鉴定

        用接种环从哥伦比亚血琼脂培养基上挑取适量的纯培养物置于盛有0.5mL生理盐水的小型离心管中，12000r/min离心2min，弃上清。再加0.5mL灭菌水，悬浮并涡旋混匀，100℃沸水中煮沸10min后，取出置于冰浴中冷却5min后，12000r/min(4℃)离心2min，取上清作为PCR模板。

        5.2.2.1 PCR反应体系

        根据不同厂家PCR试剂用量，配制PCR反应体系。同时设立阴性和阳性对照。

        5.2.2.2 PCR反应条件

        采用的PCR反应条件见下表。

        PCR反应程序表

        5.2.2.3 电泳

        5.2.2.3.1 1.0%琼脂糖凝胶板的制备

        称取1.0g琼脂糖，加入100mL0.5×TBE缓冲液(或1×TAE缓冲液)中。加热融化后加5μL(10mg/mL)溴化乙锭，混匀后倒入放置在水平台面上的凝胶盘中，胶板厚5mm左右。依据样品数选用适宜的梳子。待凝胶冷却凝固后拔出梳子(胶中形成加样孔)，放入电泳槽中，加0.5×TBE缓冲液(或1×TAE缓冲液)淹没胶面。

        5.2.2.3.2 加样

        取10µLPCR扩增产物和3µL上样缓冲液混匀后加入一个加样孔。每次电泳加阳性对照和阴性对照的扩增产物各1孔作为对照。

        5.2.2.3.3 电泳条件

        电压110V，电泳时间40min。

5.2.2.4 结果判定

        电泳结束后，取出凝胶板置于紫外投射仪上打开紫外灯观察或用凝胶成像仪进行成像分析。

        如果某一待检样品扩增产物的条带与空肠弯曲菌阳性对照的条带在一条直线上，即它们与加样孔的距离相同，则该样品分离到的菌株可判定为空肠弯曲杆菌;如果与结肠弯曲菌阳性对照的条带在一条直线上，即它们与加样孔的距离相同，则该样品分离到的菌株可判定为结肠弯曲杆菌;

        必要时，可以通过测序来进一步确证。

动物源屎肠球菌和粪肠球菌的分离与鉴定

1 范围

        本方法规定了用于屎肠球菌和粪肠球菌分离与鉴定的方法。

        本方法适用于各种动物中屎肠球菌和粪肠球菌的分离与鉴定。

2 设备和材料

        除微生物实验室常规灭菌及培养设备外，其它设备和材料如下。

        2.1 冰箱：2-4℃和-20℃。

        2.2 恒温培养箱：36±1℃。

        2.3 电子天平：感量0.1g。

        2.4 显微镜：10×～100×。

        2.5 生物安全柜。

        2.6 生化鉴定卡或商品化试条。

        2.7 采样管或商品化采样棉拭子。

        2.8 微量加样器：1μL-1000μL。

        2.9 吸头(与微量加样器匹配)。

3 培养基和试剂

        3.1 运送培养基。

        3.2 肠球菌显色培养基。

4 屎肠球菌和粪肠球菌分离与鉴定程序

        屎肠球菌和粪肠球菌分离与鉴定程序见图5。

图5：屎肠球菌和粪肠球菌分离与鉴定程序

5.操作步骤

        5.1 采样

        选择养殖场或屠宰场，灭菌棉拭子采集动物肛门或泄殖腔样品，置入运送培养基中，保存时间不超过48小时。

        5.2 屎肠球菌和粪肠球菌的分离

        5.2.1 拭子接种于肠球菌显色琼脂平板，36±1℃培养18-24h;

        5.2.2 挑取红色至紫红色的可疑菌落，显色琼脂上纯化一代，

        5.2.3 纯化后可疑菌落接种营养琼脂平板纯化，36±1℃培养16-18h，待进一步细菌鉴定。

        5.3 屎肠球菌和粪肠球菌的鉴定

        对于已纯化的菌落，可使用微生物生化鉴定系统或者生化拭条进行生化鉴定、判定结果。

        必要时，采用肠球菌标准血清进行血清型鉴定。