新测试可以诊断来自热带地区的416种病毒
来自巴西Ribeir?oPreto的圣保罗大学(USP)的研究人员开发了一个平台，分析患者的临床样本，诊断世界热带地区发现的416种感染的病毒。
来自巴西Ribeir?oPreto的圣保罗大学(USP)的研究人员开发了一个平台，分析患者的临床样本，诊断世界热带地区发现的416种感染的病毒。
根据其创建者，该工具可以由参考实验室如Adolfo Lutz研究所、Oswaldo Cruz基金会(Fiocruz)和巴西的Evandro Chagas研究所使用，以通过检测具有引起人类流行病潜力的病原体来协助流行病学监测。
圣保罗大学Ribeir?oPreto药学院(FCFRP-USP)教授，由FAPESP支持的Victor Hugo Aquino协调的研究项目的结果发表在“PLoS”杂志上。
文章的第一作者阿奎诺说：“夏天到来时，怀疑登革热，寨卡或基孔肯雅感染的患者人数会增加”。常规方法常常无法确认这些疾病的诊断，因此我们不知道哪些病毒正在流行。
在他看来，如果当Zika在巴西开始流传时，可以使用这样的工具，那么它可能限制其传播到最初的爆发地点。他说：“我们花了很长时间才意识到流行病正在进行中，因为当时没有人会想到Zika”。
除了病原体之外，平台还检测到其他尚未偶然发现但可能成为流行病的人。
实例包括Mayaro，一种与基孔肯雅相关的甲病毒，其由野生蚊子如Haemagogus janthinomys和Oropouche传播，迄今已经引起流行病限制在亚马逊河地区的河流社区，并且主要通过中草药的枸杞子传播。
阿基诺说：“有几种其他病毒还没有在人类中造成问题，但有一天可能会这样做”。 随着自然环境的退化，他们一直在不断发展，一旦被限制在自然环境中，传染病可以传播到更远的地方。
虽然该平台被设计为首先检测由节肢动物如蚊子和蜱传播的病原体，但它也可以诊断小型哺乳动物如汉坦病毒传播的感染性物质。
Aquino解释说：“选择包括发生在热带地区的所有病毒，其DNA序列保存在GenBank中，GenBank是由国家生物技术信息中心(NCBI)维护的公共数据库，其是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分。
它是
平台由具有八个相同子阵列的DNA微阵列载玻片组成，所述子阵列含有至少三次复制的病毒探针，以用15000个探针完成阵列。每个探针含有与待检测的病毒的基因组互补的60个核苷酸的序列。
根据Aquino，序列是基于来自GenBank的信息，使用生物信息学建立的。
Aquino说：“如果血液样品含有包含在微芯片上的416种病毒之一，病原体的基因组将与其中一个探针结合产生可以通过扫描仪检测到的标记”。
读取结果的装置与用于基因表达分析的微阵列分析中使用的装置相同。
阿基诺说：“最初，测试并不是为了整个人口，因为过高的成本”。它将用于怀疑登革热，寨卡或其他发热性疾病的患者，诊断未通过常规方法确诊的患者。
使用在FCFRP-USP的病毒学实验室可获得的20种病毒验证该方法。验证测试没有指出交叉杂交，其对多于一种感染性试剂产生阳性结果，并阻碍单一病毒的正确鉴定。
然而，该方法被证明，能够有效地诊断共感染的病例，例如当同一患者已被Zika和登革热感染时。
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