肝病

中国人群HCV精确基因分型和新亚群的鉴定

作者:国际肝病 来源:国际肝病 日期:2015-06-16
导读

          HCV非结构蛋白5B(NS5B)区域核苷酸测序是HCV基因分型金标准。最近,来自中国武汉大学人民医院的Tong等开发了一种新的NS5B区域核苷酸测序方法,并对该方法能否增加HCV基因测序的准确性和灵敏度进行了评估。

关键字:  HCV | 基因型 | 基因分型 |  

        HCV非结构蛋白5B(NS5B)区域核苷酸测序是HCV基因分型金标准。最近,来自中国武汉大学人民医院的Tong等开发了一种新的NS5B区域核苷酸测序方法,并对该方法能否增加HCV基因测序的准确性和灵敏度进行了评估。

        研究者通过比对HCV数据库中1127株HCV基因组序列,最终设计出8对新引物。研究发现,这些新引物扩增NS5B区域的能力优于既往设计的引物,可以更准确地鉴定HCV病毒株亚型。进一步研究证实,通过对新引物扩增DNA序列测序,可特异并正确的测定5个标准HCV亚型(1a、2a、3b、6a和1b)。此外,这些新引物可从567份临床标本中检测出所有HCV亚型,而且灵敏度高。更为重要的是,新的方法从这些标本中鉴定出3种新HCV亚型(1b-2a、1b-2k和6d-6k)。

        研究者最后总结说:“该新方法能准确测定HCV基因型,其高灵敏度有助于发现新HCV亚型,同时也有助于临床诊断、临床治疗指导、临床患者管理和HCV流行病学研究”。

        原文链接:Tong YQ, Liu B, Liu H,et al. Accurate Genotyping of Hepatitis C Virus Through Nucleotide Sequencing and Identification of New HCV Subtypes in China Population. Clin Microbiol Infect. 2015 Jun 5.

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