中国汉族人群类风湿关节炎的全基因关联性研究
为了探讨中国汉族人群类风湿关节炎患者全基因组中与发病密切相关的易感基因，我们收集类风湿关节炎患者及健康对照的DNA，在 Affymetrix6.0芯片平台进行基因分型。
近日，在中华医学会第十七次全国风湿病学术会议上，上海长征医院姜磊就“中国汉族人群类风湿关节炎的全基因关联性研究 ”做了精彩报告。
为了探讨中国汉族人群类风湿关节炎患者全基因组中与发病密切相关的易感基因，我们收集类风湿关节炎患者及健康对照的DNA，在 Affymetrix6.0芯片平台进行基因分型。
利用 GENOME STUDIO 软件进行基因分型，PLINK软件进行数据整理、标化，PCA分析对数据进行分层分析，EIGENSTRAT进行关联分析，并对结果进行GRAIL分析预测。从P值小于5E-5的单核苷酸多态性（SNP）位点中，筛选出100个候选位点，分别在TaqMan OpenArray平台和SEQUENOM平台中，对1451例病例和1559名对照以及681例病例与994名健康对照进行验证试验。
结果为，在中国汉族类风湿关节炎患者中，与患病密切相关的基因主要仍位于主要组织相容性复合物（MHC）复合体；同时，我们找到了与患病密切相关的非MHC基因位点，其中有3个非 MHC基因达到了全基因组的统计学意义（P＜5.0×10-8） 。我们验证了日本人群中报告的位于CCR6 基因的 rs1854853[combined P=4.2 × 10-10，比值比（OR）=0.787]以及与白种人报告的临近Traf-C5 区域的基因CDK5RAP2（rs12379034，combined P=6.2 × 10-12，OR=1.341）；同时，我们鉴定了与中国汉族人类风湿性关节炎密切相关的新基因 DPP4 的rs12617656（combined P=4.9×10-8， OR=1.244） 。
总之，本研究是首次针对中国汉族人类风湿关节炎进行的全基因组关联研究，证明了汉族患者易感基因遗传的独特性，为相关研究的进一步深入奠定了基础。
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