用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因
近期，首都医科大学附属北京世纪坛医院林凤等研究了用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因，研究发现，采用基因芯片技术筛选出的人子宫内膜癌获得性TAX耐药相关基因的上调基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。该文章发表于2015年19期《山东医药》上。 该研究旨在应用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中获得性紫杉
近期，首都医科大学附属北京世纪坛医院林凤等研究了用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中紫杉醇耐药相关基因，研究发现，采用基因芯片技术筛选出的人子宫内膜癌获得性TAX耐药相关基因的上调基因有S100A12、CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1。该文章发表于2015年19期《山东医药》上。
该研究旨在应用基因芯片技术筛选人子宫内膜癌细胞株中获得性紫杉醇(TAX)耐药相关基因。
研究者们采用大剂量间歇诱导法,用TAX反复冲击诱导培养人子宫内膜癌Ishikawa细胞株,建成Ishikawa/TAX耐药株。应用Affymetrix Human Genome U133 Plus2.0表达谱芯片检测Ishikawa/TAX与Ishikawa细胞株基因。通过Gene Ontology(GO)聚类分析对差异表达的基因予以分类。采用qRT-PCR对部分差异表达的基因进行验证。
结果显示，与Ishikawa细胞相比,Ishikawa/TAX细胞中有110条基因表达有显著性差异(ratio比值>3),包括87个上调基因、23个下调基因,GO分类涉及细胞信号传导和调控、细胞黏附分子、细胞代谢及转录调控等;其中上调最明显的基因为S100A12,其次有CYP1B1、FUBP1、CEACAM6,下调基因有TNFAIP3、CD44、DKK1等。qRT-PCR检测S100A12、CYP1B1在耐药细胞中高表达,TNFAIP3、CD44在耐药细胞中低表达,与基因芯片结果一致。
相关文章
评论
我要跟帖
