全球合作解密致病菌
一项由中国、德国及英国科学家合作完成的德国致病性大肠杆菌研究项目，在致病菌快速基因组测序技术和数据共享方面为应对突发传染病提供了国际典范。该研究由深圳华大基因研究院、德国汉堡埃普多夫大学医学中心、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所、英国伯明翰大学等主导完成。相关研究成果7月28日在线发表于《新英格兰医学杂志》（N Engl J Med）。
一项由中国、德国及英国科学家合作完成的德国致病性大肠杆菌研究项目，在致病菌快速基因组测序技术和数据共享方面为应对突发传染病提供了国际典范。该研究由深圳华大基因研究院、德国汉堡埃普多夫大学医学中心、中国疾病预防与控制中心和军事医学科学院微生物流行病研究所、英国伯明翰大学等主导完成。相关研究成果7月28日在线发表于《新英格兰医学杂志》（N Engl J Med）。
在此次疫情中，华大基因和德国汉堡埃普多夫大学医学中心的研究人员以最快的速度完成了对致病菌的基因组测序及分析，并向全球免费公开所有数据，并声明在公共领域许可范围内，所公开的数据没有使用限制。该数据的公开使得整个科学界在第一时间共享了相关数据信息。
据了解，华大基因研究院在收到样品后，3天内完成了大肠杆菌基因组的测序和初步组装，确定该菌株属于血清型O104，并及时将相关基因组序列数据公开分享，促进了全球生物信息学家的通力合作。
在数据发布的24小时之内，研究者完成了对该大肠杆菌的基因组组装。中国科学家团队2天内即完成了基因组特征及其菌株来源分析，从中发现，导致此次疫情的病原菌在肠聚集性大肠杆菌基础上，获得了肠出血性大肠杆菌的产志贺毒素的噬菌体序列和多种抗生素抗性基因。
在数据发布2天后，研究人员发现，引起此次疫情爆发的菌株与2001年在欧洲分离的菌株01-09591及2002年的中非分离株55989有高度相似性并展开进一步分析比较。
5天后，中国研究者研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒并在全球范围内无偿提供检测实验方案及所需引物序列信息。
2周内全球的研究人员在维基百科中公开了24篇关于该菌株的毒力、抗性基因、进化等方面最新的研究报告。
军事医学科学院微生物流行病研究所杨瑞馥教授认为，该研究成果不仅对德国致病性大肠杆菌的进化起源和致病性等方面的研究打下了坚实的基础，更为重要的是，为全球其他传染性疾病的应对机制提供了一个新的国际协作模式。
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