JCLA：一种用于鉴别犬细小病毒2型基因型的SimpleProbe®实时PCR检测方法
在本研究中，我们比较了SimpleProbe®real time PCR和DNA测序分析获得的CPV‐2基因分型结果，以确定这些方法的准确性和敏感性。
犬细小病毒2型(CPV‐2)可在全世界引起重要的犬病毒性疾病。CPV‐2属于细小病毒科原病毒属。VP2蛋白中426位的氨基酸变化可区分CPV‐2，分别为CPV‐2a (Asn)、CPV‐2b (Asp)和CPV‐2c (Glu)。在本研究中，我们比较了SimpleProbe®real time PCR和DNA测序分析获得的CPV‐2基因分型结果，以确定这些方法的准确性和敏感性。
2015年至2017年，在国立屏东科技大学动物疾病诊断中心，从CPV‐2自然感染的犬只中收集了100份直肠拭子。采用SimpleProbe®real time PCR和DNA测序对CPV‐2基因分型进行比较。
研究发现，两种技术获得的CPV‐2a (n = 23)、2b (n = 6)和2c (n = 71)基因分型结果与SimpleProbe®检测的特异性100%相同。在SimpleProbe®实验中，从临床标本中扩增出的dna显示出三个不同的熔融曲线峰。CPV‐2b的熔点最高为57.8°C (CI 95%: 57.7‐58.5°C)，其次为CPV‐2c，熔点稍低，为52.3°C (CI 95%: 52.2‐53.2°C)，CPV‐2a，熔点最低，为50.2°C (CI 95%: 50.1‐50.5°C)。
本研究开发了一种利用SimpleProbe®实时PCR方法对CPV‐2菌株进行基因分型的新方法。研究表明，本实验是鉴别CPV‐2a、2b和2c的可靠而灵敏的工具，该技术可用于分子CPV‐2流行病学研究。
原始出处：
Minh Hoang,Hung‐Yi Wu,A SimpleProbe® real‐time PCR assay for differentiating the canine parvovirus type 2 genotype
相关文章
评论
我要跟帖
