随着肠道微生物的研究愈发受到重视,它的概念和作用也逐渐“飞入寻常百姓家”,为大家所了解。无论是研究人员还是科普人士都会提醒大家,“肠道微生物的平衡和稳态很重要,我们要保护肠道内有益的微生物” “要多吃富含膳食纤维的食物,对肠道微生物好” “要少用抗生素,会伤害肠道微生物,导致菌群失调”。
这么多忠告,记住了结论的同时,你想知道为什么吗?今天,我们就要“知其然也知其所以然”,奇点糕要通过一个新发表在《科学》杂志上的研究告诉大家,富含膳食纤维的食物对肠道微生物好,而抗生素会破坏菌群平衡的原因。
这项研究由加州大学戴维斯分校医学院的 Andreas Bäumler 教授带领团队完成 [1]。我们的肠道通常是缺少氧气的,有很多厌氧微生物生活在其中,比如厚壁菌门和拟杆菌门的细菌,它们量大而又活跃,避免一些可以致病的肠杆菌科细菌过度繁殖,像大名鼎鼎的大肠杆菌和沙门氏菌。而且还可以消化我们吃掉的食物,产生一些有益的代谢物,比如丁酸盐。
这些厌氧细菌是如何全面压制肠杆菌科细菌的呢?主要是通过限制硝酸盐和氧气的产生 [2,3]。因为大肠杆菌和沙门氏菌等肠杆菌科细菌都是兼性厌氧菌,它们在无氧和有氧的环境下均可以生长,不过在无氧环境下它们只能维持基本的繁殖,无法壮大家族,而有氧环境则更可以让它们繁殖能力猛增。
不过氧气含量增加对于有益肠道的厌氧细菌来说就很不友好了,它们难以在这样的环境中存活。这就带来了一个问题,有益的厌氧细菌会减少,而肠杆菌科细菌会大量繁殖,这是肠道内稳态失调的一个标志。
早在 2013 年,Bäumler 教授就发现大肠杆菌等细菌可以利用硝酸盐作为氧气来源,进行有氧呼吸,使得本就菌群失调的炎症性肠病患者的有益菌更少,炎症更加严重。这项成果也发表在《科学》杂志上 [4]。
那么硝酸盐和氧气是如何增加的呢?这就是 Bäumler 教授的新发现了。首先,如果要产生硝酸盐,诱导型一氧化氮合酶(iNOS)是一个重要的因素,于是研究人员诱导了它的编码基因 NOS2 在结肠上皮细胞中的表达,然后将这些细胞放入含有大量丁酸盐的培养基中培养。
丁酸盐是由一系列丁酸盐产生菌分解膳食纤维产生的,具有抗炎和免疫调节功能,这些丁酸盐产生菌是严格的厌氧菌,也是肠道菌群中的重要功能类群。甚至有科学家认为,它们会成为治疗炎症性肠病的新“药物”。研究人员发现,丁酸盐明显抑制了 NOS2 的表达,减少了 iNOS 的产生,自然也减少了硝酸盐的量。也就是说,丁酸盐可能正是硝酸盐产生的“克星”,它的存在让肠杆菌科细菌失去了氧气来源,不能大量繁殖。
而丁酸盐作用的信号通路中有一条比较特殊,就是 PPAR-γ(过氧化物酶体增殖物激活受体 -γ)通路。PPAR-γ是重要的转录因子,在肠道中高水平表达 [5],它特殊的点在于,只能响应丁酸盐,其他的短链脂肪酸和它都“不匹配”[6]。
那么这条“唯一的通路”和抑制硝酸盐的产生有没有关系呢?事实证明是有的。研究人员再次培养了诱导表达 NOS2 的结肠上皮细胞,用 PPAR-γ激动剂罗格列酮(一种曾用于治疗 II 型 的药物)去处理它,发现 iNOS 和硝酸盐的产生都减少了。
在野生型小鼠(WT)和缺少 PPAR-γ小鼠(Pparg)几种丁酸盐产生菌比例相差不大(B)的情况下,野生型小鼠(WT)和缺少 PPAR-γ小鼠(Pparg)NOS2 表达量的对比(A)
在小鼠体内进行的实验中,研究人员使用基因工程手段获得了缺少 PPAR-γ的小鼠,发现与野生型小鼠相比,即使不刻意杀死丁酸盐产生菌、减少丁酸盐含量,PPAR-γ缺陷小鼠的 NOS2 表达水平仍然明显增加。这就表明,PPAR-γ这条信号通路的存在对抑制硝酸盐的产生是必要的。综合这些实验,我们可以得到这样一个思路:当摄入了富含膳食纤维的食物后,肠道中一系列厌氧的丁酸盐产生菌可以分解它们,产生丁酸盐,通过关键的 PPAR-γ通路抑制了肠道细胞中 NOS2 的表达,减少了 iNOS 和硝酸盐的产生。这样,肠杆菌科细菌就不能利用硝酸盐来进行有氧呼吸,不能大量繁殖,也就不会破坏肠道菌群稳态。
接下来,研究人员使用链霉素处理了野生型小鼠,链霉素是一类非常常用的抗生素,可以用来治疗结核病。它的处理显著减少了小鼠肠道细菌的数量,尤其是梭菌纲细菌,其中包含许多丁酸盐产生菌。意料之中的,丁酸盐的水平出现了明显的下降,NOS2 的表达则上升了,同时硝酸盐的利用率也增加了。而且,他们发现一个受到 PPAR-γ正调控的基因表达出现了下调,当给这些小鼠使用罗格列酮时,它的表达又得到了恢复,硝酸盐的产生和利用也得到了抑制。
未使用链霉素处理(-)和使用链霉素处理(+)调节性 T 细胞的量的对比
在肠炎小鼠模型中,使用链霉素减少了丁酸盐产生菌,PPAR-γ信号通路被抑制,小鼠肠腔中氧气和氧气利用率增加。但是他们发现了一个很有意思的事情,不使用抗生素杀死丁酸盐产生菌,而只单单抑制 PPAR-γ时产生的氧气是少于使用抗生素的,这是为什么呢?
研究人员想,问题可能出在了丁酸盐这里,包括它在内的短链脂肪酸对肠道中免疫细胞的成熟起着重要作用,尤其是调节性 T 细胞,它起着抑制促炎症反应的作用,过去的研究也显示,抗生素的使用会减少调节性 T 细胞的量 [7]。于是研究人员进行了实验,果然,用链霉素处理后,调节性 T 细胞的量减少到了原来正常值的 1 /3!接下来,研究人员又验证了单独缺少调节性 T 细胞时,产生的氧气同样是相对较少的,而只有它和 PPAR-γ同时被抑制,才能达到足够的氧气含量。
这说明,丁酸盐不仅作用于肠道上皮细胞,免疫细胞也同样受到它的调节,共同维护肠道中的缺氧状态,创造适合有益菌生长繁殖的环境。
这个研究为我们指出了,PPAR-γ在维持肠道菌群平衡中是一个重要且必要的信号通路,而当肠杆菌科的致病菌增加,打破肠道菌群平衡甚至导致了疾病时,靶向 PPAR-γ也可以是一个潜在的治疗方法。最后的最后,奇点糕还要再次提醒大家,多吃富含膳食纤维的食物,谨慎使用抗生素!
参考文献:
[1] Mariana B, et al. Microbiota-activated PPAR-g signaling inhibits dysbiotic Enterobacteriaceae expansion. Science, 2017, DOI: 10.1126/science.aam9949
[2] Spees A M, Wangdi T, Lopez C A, et al. Streptomycin-induced inflammation enhances Escherichia coli gut colonization through nitrate respiration[J]. MBio, 2013, 4(4): e00430-13.
[3] Rivera-Chávez F, Zhang L F, Faber F, et al. Depletion of butyrate-producing clostridia from the gut microbiota drives an aerobic luminal expansion of Salmonella[J]. Cell host & microbe, 2016, 19(4): 443-454.
[4] Winter S E, Winter M G, Xavier M N, et al. Host-derived nitrate boosts growth of E. coli in the inflamed gut[J]. science, 2013, 339(6120): 708-711.
[5] Lefebvre M, Paulweber B, Fajas L, et al. Peroxisome proliferator-activated receptor gamma is induced during differentiation of colon epithelium cells[J]. Journal of Endocrinology, 1999, 162(3): 331-340.
[6] Alex S, Lange K, Amolo T, et al. Short-chain fatty acids stimulate angiopoietin-like 4 synthesis in human colon adenocarcinoma cells by activating peroxisome proliferator-activated receptor γ[J]. Molecular and Cellular Biology, 2013, 33(7): 1303-1316.
[7] Atarashi K, Tanoue T, Shima T, et al. Induction of colonic regulatory T cells by indigenous Clostridium species[J]. Science, 2011, 331(6015): 337-341.
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