Kruppel样因子4在胃癌细胞中的表达及KLF4基因启动子区的生物信息学分析
作者：书芳 整理 来源： 日期：2016-04-29
导读
近日，研究人员发表论文，旨在检测Kruppel样因子KLF4基因在人胃癌细胞株MKN-45及人正常胃黏膜上皮细胞株GES-1的表达情况，并应用生物信息学方法分析KLF4基因启动子区序列，预测胃癌发生中其涉及的转录调控因子。研究指出，KLF4mRNA在胃癌细胞株MKN-45中表达下调，生物信息学分析提示在胃癌发生中AP-1、AP-2、HIF-1、SP3转录因子等可能参与调控KLF4的表达。该文
近日，研究人员发表论文，旨在检测Kruppel样因子KLF4基因在人胃癌细胞株MKN-45及人正常胃黏膜上皮细胞株GES-1的表达情况，并应用生物信息学方法分析KLF4基因启动子区序列，预测胃癌发生中其涉及的转录调控因子。研究指出， KLF4 mRNA在胃癌细胞株MKN-45中表达下调，生物信息学分析提示在胃癌发生中 AP-1、AP-2、HIF-1、SP3转录因子等可能参与调控KLF4的表达。该文发表在《中国老年学杂志》2015年第09期上。
采用实时荧光定量 PCR 方法检测 MKN-45及 GES-1中 KLF4 mRNA的表达；利用多种在线软件获取并分析人KLF4基因启动子序列，预测其转录因子结合位点和胃癌组织中相关的转录因子。
实时定量PCR检测结果显示：KLF4 mRNA在人胃癌细胞株MKN-45中的表达低于在人正常胃黏膜细胞株 GES-1中的表达（4.24±0.15 vs 6.66±0.23）（ P＜0.01）；KLF4基因启动子序列全长为4915 bp，共涉及183个转录因子结合位点，在胃癌中异常表达的转录因子有17个，包括AP-1、AP-2、HIF-1、SP3等。
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