由于TET1,TET2,TET3和TDG中的突变,DNA甲基化/去甲基化循环的不平衡与乳腺癌的发病和进展有一定关系。然而,目前很少有研究评估TET相关DNA去甲基化途径的遗传变异与乳腺癌风险之间的关系,特别是在非洲祖先妇女群体上。
由于TET1,TET2,TET3和TDG中的突变,DNA甲基化/去甲基化循环的不平衡与乳腺癌的发病和进展有一定关系。然而,目前很少有研究评估TET相关DNA去甲基化途径的遗传变异与乳腺癌风险之间的关系,特别是在非洲祖先妇女群体上。
研究人员调查了4个TET相关DNA去甲基化途径基因中的4095个单核苷酸多态性(SNP),其中包括非洲血统妇女,包含1657例[403雌激素受体阳性(ER +)和374 ER阴性(ER-)]和2029对照。使用与高度相关性(r 2 <0.8)的925个SNP的自适应级别截断产物(ARTP)检验进行甲基化途径和基因水平分析,并使用Logistic回归进行SNP级分析,用于估计优势比(OR)和95%置信区间(CI)。
结果显示TET相关DNA去甲基化途径与ER阴性乳腺癌显著相关(P = 0.049)。基因水平分析显示,TET1是导致通路水平关联的候选基因(P = 0.008)。SNP TET1 rs10998376(OR = 1.21,95%CI = 1.02-1.42,P adj = 0.0032)即使在多重比较的基因水平校正后也具有统计学意义,并且与风险增的相关。在Boferroni矫正后,ARTP检测中P > 0.05的基因SNP均无显著性差异。
结论表明,特定的TET相关DNA去甲基化途径基因可能促进了乳腺癌的风险,特别是对非洲血统妇女的ER阴性肿瘤的风险。
原始出处:
Kris M. Lee, Shengfeng Wang, Dezheng Huo,. et.al.Association of breast cancer risk in women of African ancestry with genetic variants in the TET-related DNA demethylation pathway.ASCO2017
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