目的 建立并优化慢性心衰尿液双向电泳技术以提高其分辨率及重复性。方法 收取尿液标本后,采用超滤法富集并浓缩尿液蛋白,Bradford法测浓度后进行双向电泳;第一向为等电聚焦,第二向为SDS-PAGE胶;凝胶经银染显色后,用Melanie 4软件分析2-DE图谱。分别对上样量,聚焦参数等步骤进行优化。
目的 建立并优化慢性心衰尿液双向电泳技术以提高其分辨率及重复性。
方法 收取尿液标本后,采用超滤法富集并浓缩尿液蛋白,Bradford法测浓度后进行双向电泳;第一向为等电聚焦,第二向为SDS-PAGE胶;凝胶经银染显色后,用Melanie 4软件分析2-DE图谱。分别对上样量,聚焦参数等步骤进行优化。
结果 (1)不同上样量对2-DE图谱的影响:为了比较不同上样量对尿液2-DE的影响,探索更合理的上样量;我们分别进行了150μg(IPG pH3-10NL,24 cm)和250μg(IPG pH3-10NL,24 cm)两组上样量的比较。图1A上样量为250μg,图谱上有些蛋白点过饱和,许多蛋白质点融合在一起;掩盖附近一些低丰度蛋白的表达,使其分辨率降低,且其图染色背景较深。图1B上样量为150μg,尽管蛋白上样量较图1A少,但整个图谱效果明显好于图1A,虽然出现的蛋白点要少于前图,但大部分蛋白质点能够清晰分辨,背景较为清晰,以便进行后续的差异点的辨认和鉴定等后续实验。因此后续实验我们的上样量一般为150μg。
(2)不同聚焦参数对2-DE图谱的影响: 如果聚焦伏特数不够,蛋白就有可能到达不了相应的等电点部位,一方面出现的蛋白点较少,另一方面会在2-D图谱上出现横条纹:反之如果聚焦过度,蛋白就会在等电点附近发生沉淀,同样也会在2-D图谱上出现横条纹。为了获取理想的蛋白图谱,我们在实验过程中不断比较了50 KVh/60 KVh两组实验,即聚焦程序:100V 1h, 500 V 1h, 1000 V 1h, 8 000 V 3h, 8 000 V 50/60 KVh,500 V 3h。结果发现聚焦总伏特数50 KVh组相应的蛋白图谱的蛋白点少,横条纹较多(图2A),系聚焦不够,部分蛋白没有到达相应的等电点所致;而对比之下聚焦总伏特数60 KVh组的2-D图谱上不仅蛋白点较多,而且横条纹也大大减少(图2B),分离效果较好。因此我们认为60 KVh对于尿液蛋白是聚焦适度的。
结论 建立稳定性高,重复性好的慢性心衰尿液双向凝胶电泳技术,从蛋白组水平研究慢性心衰奠定了基础。
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