RAPD结合微流芯片快速鉴定马拉菌种
作者：张辉摘编 来源：金宝搏网站登录技巧
日期：2012-08-28
导读
上海复旦大学附属华山医院皮肤科的一项研究表明，随机扩增多态性DNA（RAPD）结合微流芯片方法作为一种快速、高通量、高灵敏性的分析技术，在马拉色菌种间菌株遗传多样性、亲缘关系的分析及新种鉴定中显示出一定优越性。该论文发表在《中华皮肤外科杂志》[2012 Vol. 45 (8): 545-548 ]。
上海复旦大学附属华山医院皮肤科的一项研究表明，随机扩增多态性DNA（RAPD）结合微流芯片方法作为一种快速、高通量、高灵敏性的分析技术，在马拉色菌种间菌株遗传多样性、亲缘关系的分析及新种鉴定中显示出一定优越性。该论文发表在《中华皮肤外科杂志》[2012 Vol. 45 (8): 545-548 ]。
研究者 收集马拉色菌标准菌株及直接镜检阳性的花斑糠疹患者皮损处皮屑及马拉色菌毛囊炎患者皮损处毛囊内容物培养出的马拉色菌菌株进行DNA测序，鉴定菌种，随机扩增多态性DNA聚合酶链反应（RAPD-PCR）电泳分析及微流芯片基因型定量分析并聚类分析树状图。
结果显示，共分离83株马拉色菌临床菌株，其中72株分离自花斑糠疹，11株分离自马拉色菌毛囊炎。大多数菌株均可被2种随机引物（S22、S24）扩增而获得清晰条带，但以S22引物扩增的条带更为稳定、清晰，作为主要引物。不同种马拉色菌通过微流芯片基因型定量分析得到不同大小的固定阳性条带，所有菌株均可见种间和种内多态性。在DNA测序的基础上，使用RAPD结合微流芯片方法，基本可将8种马拉色菌（糠秕、合轴、球形、厚皮、斯洛菲、日本、大和及皮肤马拉色菌）区别。
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