[中国心脏大会]对238例间隔缺损型先天性心脏病患者的基因拷贝数变异的研究
背景及目的：目前大部分散发性先天性心脏病（CHD）的发病机制尚不明确。随着人类基因组测序的完成，一些新的遗传变异被发现并日益受到重视。其中，基因拷贝数变异（copy number variation，CNV）目前最受关注。CNV是指广泛存在于基因组的大小从1 kb~5 Mb的DNA片段CNV，包括缺失和复制。由于其发生的频率远远高于染色体结构变异，而且在整个基因组中覆盖的核苷酸总数大大超过单核苷酸多态性的总数，所以CNV可能与表型变异紧密关联。近年来，CNV与先心病
背景及目的：目前大部分散发性先天性心脏病（CHD）的发病机制尚不明确。随着人类基因组测序的完成，一些新的遗传变异被发现并日益受到重视。其中，基因拷贝数变异（copy number variation，CNV）目前最受关注。CNV是指广泛存在于基因组的大小从1 kb~5 Mb的DNA片段CNV，包括缺失和复制。由于其发生的频率远远高于染色体结构变异，而且在整个基因组中覆盖的核苷酸总数大大超过单核苷酸多态性的总数，所以CNV可能与表型变异紧密关联。近年来，CNV与先心病发病关系的研究受到重视。随着比较基因组杂交技术（CGH）的出现，越来越多的染色体不平衡变异在CHD患者中被发现，为CHD的发病机制提供了新的研究方向。最近的研究显示在CHD患者中，22q11.2缺失发生率达1.4–2.5%，其中以TOF及VSD的发生率最高。既往研究发现在间隔缺损为主的CHD患者中存在NKX2-5、GATA4、TBX5、BMP4、CRELD1基因的突变，但大部分散发病例突变阴性，是否存在上述基因的拷贝数变异尚不清楚。本研究通过检测NKX2-5、GATA4、TBX5、BMP4、CRELD1基因CNV及22q11.2缺失在间隔缺为主CHD患者的分布情况，旨在进一步探讨CHD发病机制。
方法：采用多重连接依赖的探针扩增（MLPA）技术对238例散发性间隔缺损为主的、非综合征型CHD患者进行分析，包括78例ASD，58例VSD，102例TOF。另选择200例年龄、性别匹配的健康儿童为正常对照组。
结果：在6例TOF患儿中发现6个CNV，进行qPCR及微卫星验证后，证实为5个22q11.2 缺失，1个CRELD1基因的拷贝数重复，其中4个22q11.2缺失的长度为3 Mb，是最常见的缺失类型，另一个22q11.2缺失的长度在0.5-1Mb之间，其中覆盖了TBX-1基因，目前尚未有报道。在200例正常对照中均未检测出上述变异。
结论：我们的数据显示CNV在CHD发病中起非常重要的作用，CRELD1基因的CNV是可能是部分CHD病人的发病原因，22q11.2缺失在238例CHD患者中的发病率是2.1%。
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