近期,有人发表了一篇斯堪的那维亚/德国原发性硬化性胆管炎(PSC)全基因组相关性研究(GWAS),挪威Folseraas等报告了一项对该研究数据进行的扩展分析结果,显示通过对其他相关的阈值下信号进行复制,能够识别出几个新的PSC易感基因,尽管多数基因可作为PSC自身免疫易感性证据的补充,但FUT2的结果有可能提示其他发病机制的存在。
近期,有人发表了一篇斯堪的那维亚/德国原发性硬化性胆管炎(PSC)全基因组相关性研究(GWAS),挪威Folseraas等报告了一项对该研究数据进行的扩展分析结果,显示通过对其他相关的阈值下信号进行复制,能够识别出几个新的PSC易感基因,尽管多数基因可作为PSC自身免疫易感性证据的补充,但FUT2的结果有可能提示其他发病机制的存在。
研究者在715例PSC患者和2962例对照者中,检测了基因型、相关单核苷酸多态性(SNP)(n=2466182)的关联。并在进一步分析中排除了已知的危险基因座。研究者根据GWAS中其他免疫相关疾病的结果(http://www.genome.gov/26525384)以及在相关区域内的功能型候选基因,对包括1147个PSC病例和2336名对照者的独立病例/对照组中的共52个SNP进行了基因型分析,随后采用Cochrane-Mantel-Haenszel检验进行关联分析。使用加权Z评分综合最初GWAS的结果和复制的结果。
在复制分析中,8个SNP达到了微弱的显著性(表1)。在FUT2基因中检出了新的强关联性(P-联合= 1.1×10-5和4.3×10-6),该基因编码1种与上皮多糖包被(epithelial glycocalyx)合成相关的酶,上皮多糖包被影响黏膜感染的易感性。此外,在存在如下免疫相关基因的基因座中,也检测到了新的关联:CLEC16A(P-联合=2.7×10-5)、UBASH3A(P-联合=0.00024)和SH2B3(P-联合=0.00033)。在GGT基因也有微弱的显著关联(P-联合=0.0029),需要进一步验证。IL2/IL21/KIAA1109(P-联合=1.7×10-6)和REL(P-联合=0.00015)中的相关性,证实了既往在这些基因座中的所见。
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