研究目的: 本研究旨在利用网络药理学和分子对接分析,探索舒肺压方治疗肺动脉高压(PH)的分子机制。 研究方法: 利用TCMSP数据库对方剂中的活性成分及其目标蛋白进行筛选。使用GeneCards、STRING数据库和Cytoscape-v3.8.2筛选PH相关的核心蛋白。通过这些配方活性成分的目标蛋白和PH值相关的核心蛋白的交集得到共同蛋白。利用Rx64 4.0.2软件对共同蛋白进行GO功能富集
研究目的:
本研究旨在利用网络药理学和分子对接分析,探索舒肺压方治疗肺动脉高压(PH)的分子机制。
研究方法:
利用TCMSP数据库对方剂中的活性成分及其目标蛋白进行筛选。使用GeneCards、STRING数据库和Cytoscape-v3.8.2筛选PH相关的核心蛋白。通过这些配方活性成分的目标蛋白和PH值相关的核心蛋白的交集得到共同蛋白。利用Rx64 4.0.2软件对共同蛋白进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,得到通路富集蛋白,然后对核心富集蛋白进行进一步筛选。我们用Cytoscape-v3.8.2分析了活性成分与通路富集蛋白之间的关系。使用AutoDock Vina将其核心蛋白对接到组件中。
研究结果:
舒肺压方配方含有67种活性成分。获得了61个活性成分的目标蛋白和PH相关核心蛋白的共同蛋白。该处理方法涉及功能和途径的调节。核心通路富集的蛋白是前列腺素G/H合成酶2(PTGS2)、表皮生长因子受体(EGFR)和RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1),它们与相应成分的结合能都小于-5 kJ-mol-1。
研究结论:
研究发现,主要机制可能是活性成分作用于核心通路富集蛋白,调节相关信号通路,从而在抗凝、血管扩张、抗PASMC增殖、促进PAECs凋亡、抑制氧化应激和抗炎作用等方面发挥作用。
参考文献:
Zhang Z, Wang X, Wang S, Jia Z, Mao J.Network Pharmacology and Molecular Docking Analysis of Shufeiya Recipe in the Treatment of Pulmonary Hypertension.Biomed Res Int. 2022 Dec 28;2022:7864976. doi: 10.1155/2022/7864976. PMID: 36756383; PMCID: PMC9900250.
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