原发性和转移性前列腺肿瘤的前瞻性综合基因组分析
综合基因组分析(CGP)在常规前列腺癌临床治疗中越来越多的被使用。最近，有研究人员为了指定有针对性的治疗策略，利用CGP对3476例临床晚期前列腺肿瘤进行了基因组变异(GAs)和基因组不稳定特性分析。 前列腺癌样本包括了1660个原发性位点和1816个转移性肿瘤位点。研究人员对这些样本进行了CGP前瞻性分析。研究发现，高频变异基因包括TP53 (44%)、PTEN (32%)、TMPRSS2-E
综合基因组分析(CGP)在常规前列腺癌临床治疗中越来越多的被使用。最近，有研究人员为了指定有针对性的治疗策略，利用CGP对3476例临床晚期前列腺肿瘤进行了基因组变异(GAs)和基因组不稳定特性分析。
前列腺癌样本包括了1660个原发性位点和1816个转移性肿瘤位点。研究人员对这些样本进行了CGP前瞻性分析。研究发现，高频变异基因包括TP53 (44%)、PTEN (32%)、TMPRSS2-ERG (31%)和AR (23%)。潜在靶向Gas通常存在于DNA修复途径、磷脂酰肌醇3激酶和RAS/RAF/MEK途径。DNA修复途径的GAs包括同源重组修复(23%)、凡科尼贫血(5%)、CDK12(6%)和错配修复(4%)。BRCA1/2、ATR和FANCA GAs与高gLOH相关，而CDK12变异肿瘤则很少表现出高gLOH。另外，TMB均值低(2.6变异/Mb)。更多的是，一小部分案例(3%)具有高TMB，且其中71%的案例同时具有高MSI。与原发性肿瘤相比，转移位点肿瘤在11q13扩增子中富集(CCND1/FGF19/FGF4/FGF3)，GAs在AR， LYN， MYC， NCOR1， PIK3CB和RB1中富集。
最后，研究人员指出，常规临床CGP鉴定的GAs是57%案例中针对性治疗的可调查生物标记。gLOH和MSI/TMB特性分别能够进一步的促进多聚酶抑制剂和免疫治疗的选择。结合gLOH与DNA修复GAs的相关性鉴定除了与同源重组缺陷相关的基因。GAs富集在转移位点肿瘤中表明了转移性前列腺癌的治疗策略。临床结果相关性的缺乏是他们研究的一个限制因素。
原始出处：
Chung JH， Dewal N， Sokol E et al.Prospective Comprehensive Genomic Profiling of Primary and Metastatic Prostate Tumors. JCO Precis Oncol. 2019
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