眼科

视网膜色素上皮细胞氧化应激相关microRNA的鉴定

作者:杨俊岭 整理 来源:金宝搏网站登录技巧 日期:2016-05-06
导读

           近期,西安交通大学第二附属医院眼科研究人员发表论文,旨在应用miRNA表达谱芯片筛选视网膜色素上皮细胞与氧化应激相关的miRNA,为更加全面深入地研究年龄相关性黄斑病变(age-relatedmaculardegeneration,AMD)发生的分子机制提供新的思路。研究指出,H2O2作用前后RPE的miRNA表达存在明显差异,miRNA作为转录后水平的调节分子,参与了细胞氧化应激反应,可能

  近期,西安交通大学第二附属医院眼科研究人员发表论文,旨在应用miRNA表达谱芯片筛选视网膜色素上皮细胞氧化应激相关的miRNA,为更加全面深入地研究年龄相关性黄斑病变(age-related macular degeneration,AMD)发生的分子机制提供新的思路。研究指出,H2O2作用前后RPE的miRNA表达存在明显差异,miRNA作为转录后水平的调节分子,参与了细胞氧化应激反应,可能在AMD的发生发展中起有重要作用。该文发表在2015年第09期《国际眼科杂志》上。

  培养D407细胞,分别使用100、200、400μmol/L H2O2处理细胞24h后,Trizol试剂抽提细胞总RNA,使用Exiqon miRCURY LNA TM microRNA表达谱芯片(miRBase16.0数据库)检测不同浓度处理后D407细胞miRNA的表达差异,并将不同浓度处理后的变化进行聚类分析。使用Stem loop realtime PCR对芯片结果进行验证,并运用生物信息学方法预测差异miRNA调控的靶基因。

  芯片所包含的1425个已知miRNA中,共有367个在不同浓度H2O2处理后表达发生变化。通过Treeview软件进行聚类分析发现miR-31等17个miRNA随H2O2浓度的升高呈现逐渐降低的趋势,miR-206等7个则逐渐升高。PCR验证显示芯片结果准确性较好。

   相关链接:http://med.wanfangdata.com.cn/Journal/mzgjykzz.aspx

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