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基础医学

脱腐预处理对土壤总DNA提取质量的影响

作者:杨俊岭 整理 来源: 日期:2016-05-04
导读

           近期,郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室研究人员发表论文,旨在探索一种提高土壤总DNA提取质量的简易脱腐方法。研究指出,脱腐预处理方法提取的土壤总DNA更有利于后续分子生物学实验。该文发表在2015年第10期《环境与健康杂志》上。   于2014年3月,采集河南省某市农田4个采样区的混合土样(07、08、1A、2A)。分别用脱腐预处理后试剂盒提取(预处理组)和直接试剂盒提取法(未预处理组)

  近期,郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室研究人员发表论文,旨在探索一种提高土壤总DNA提取质量的简易脱腐方法。研究指出,脱腐预处理方法提取的土壤总DNA更有利于后续分子生物学实验。该文发表在2015年第10期《环境与健康杂志》上。

  于2014年3月,采集河南省某市农田4个采样区的混合土样(07、08、1A、2A)。分别用脱腐预处理后试剂盒提取(预处理组)和直接试剂盒提取法(未预处理组)提取土样总DNA,对保守序列16S r DNA和非保守序列(抗生素抗性基因sulⅡ、tet M、tet C和1类整合子酶基因int I1)进行PCR扩增。采用Gene Genius凝胶成像系统定量分析软件Gene Tools进行灰度值分析。

  结果显示, 预处理组和未预处理组提取的各个土壤总DNA均可扩增出16S r DNA,且PCR产物灰度值差异无统计学意义(均P>0.05);非保守序列sulⅡ、tet C和int I1基因的PCR扩增产物灰度值在两组中差异无统计学意义(均P>0.05);预处理组tet M基因的表达水平高于未预处理组,差异有统计学意义(P<0.05)。未预处理组的sulⅡ、tet M、tet C和int I1基因PCR扩增产物中均检测出了非特异性条带,而预处理组目的条带单一、较少非特异性条带。

   相关链接:http://med.wanfangdata.com.cn/Periodical/hjyjkzz

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