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基础医学

沉香DNA的提取及其ITS2-PCR体系的优化

作者:杨俊岭 整理 来源: 日期:2016-03-29
导读

  近期,广东药学院药科学院研究人员发表论文,旨在建立沉香的总DNA提取方法及rDNA第二内转录间隔区序列(ITS2)聚合酶链式反应(PCR)扩增体系。研究指出,CTAB法联合DNA试剂盒法可简单、快速获得高质量沉香总DNA,正交试验可快速获得ITS2目的片段,为沉香的分子鉴定和系统发育分析提供参考。该文发表在2015年第02期《中国实验方剂学杂志》上。   分别采用改良的CTAB法、改良的CT

关键字: 沉香 | | DNA提取 | | ITS2 | | 聚合酶链式反应 |

  近期,广东药学院药科学院研究人员发表论文,旨在建立沉香的总DNA提取方法及r DNA第二内转录间隔区序列(ITS2聚合酶链式反应(PCR)扩增体系。研究指出,CTAB法联合DNA试剂盒法可简单、快速获得高质量沉香总DNA,正交试验可快速获得ITS2目的片段,为沉香的分子鉴定和系统发育分析提供参考。该文发表在2015年第02期《中国实验方剂学杂志》上。

  分别采用改良的CTAB法、改良的CTAB法联合DNA提取试剂盒法及DNA提取试剂盒法提取沉香总DNA,利用通用引物ITS2P1/ITS2P2扩增r DNA ITS2目的片段,通过正交试验优选沉香的PCR扩增条件并对目的片段进行测序。

  结果显示, 改良的CTAB法联合DNA提取试剂盒法提取总DNA的A260 nm/A280 nm1.79,质量浓度350 mg·L-1,PCR扩增目的片段产率最高。不同因素水平对沉香ITS2-PCR反应的影响顺序为模板DNA>引物>Taq DNA聚合酶>d NTP。最佳反应体系为20μL体系,DNA模板40 ng,引物0.2 mmol·L-1,d NTP 0.5 mmol·L-1,Taq DNA聚合酶1.5 U。测序获得的目前片段长度230 bp,与Gen Bank中瑞香科沉香属白木香序列相似性100%。

   相关链接:http://med.wanfangdata.com.cn/Periodical/zgsyfjxzz

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