刚地弓形虫ROP18基因的克隆及生物信息学分析
近期，河北北方学院病原生物与免疫学研究所研究人员发表论文，旨在对刚地弓形虫RH株的棒状体蛋白18（TgROP18）基因进行克隆，同时采用生物信息学分析TgROP18蛋白序列。研究指出，生物信息学分析表明，TgROP18蛋白具有良好的免疫原性，这将为弓形虫疫苗的研究提供基础资料。该文发表在2015年第05期《中国病原生物学杂志》上。 提取刚地弓形虫RH株速殖子总RNA，根据TgROP18基
近期，河北北方学院病原生物与免疫学研究所研究人员发表论文，旨在对刚地弓形虫RH株的棒状体蛋白18（TgROP18）基因进行克隆，同时采用生物信息学分析TgROP18蛋白序列。研究指出，生物信息学分析表明，TgROP18蛋白具有良好的免疫原性，这将为弓形虫疫苗的研究提供基础资料。该文发表在2015年第05期《中国病原生物学杂志》上。
提取刚地弓形虫RH株速殖子总RNA，根据TgROP18基因（GenBank登陆号为AM075204）的开放阅读框设计引物，采用逆转录PCR（RT-PCR）扩增ROP18基因，并对其产物进行测序；采用在线生物软件预测TgROP18蛋白的结构与功能。
结果显示， TgROP18基因RT-PCR扩增产物与预期一致，大小为1 665bp；测序分析显示，ROP18基因序列与GenBank上已发表的序列完全一致。TgROP18蛋白含有554个氨基酸，分子式为C2753H4405N801O811S20，分子质量单位为62.34ku，理论等电点为9.34；在TgROP18蛋白的二级结构中，α-螺旋、β-折、β-转角、无规则卷曲所占比例分别为41.52%、19.13%、7.76%和31.59%；TgROP18蛋白含有10个亲水性较高的区域（临界值为2.0），28个表面可及性较高的区域（临界值为1.9），10个保守结构区域，7个翻译后修饰位点，21个B细胞抗原表位，21个CTL抗原表位及26个Th抗原表位有。
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