转录因子THAP1在人肺泡Ⅱ型上皮细胞中结合靶基因的谱系分析
近期，南京医科大学第一附属医院儿科研究人员发表论文，旨在确定转录因子THAP1的靶基因，为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。研究指出，初步确定了转录因子THAP1在肺泡Ⅱ型上皮细胞中的靶基因结合序列，提示THAP1广泛参与了多种生物学过程，为研究THAP1的功能及作用机制研究提供了线索，从而为新生儿肺损伤的治疗奠定了基础。该文发表在2015年第09期《南京医科大学学报（自然科学版）》杂志上。
近期，南京医科大学第一附属医院儿科研究人员发表论文，旨在确定转录因子THAP1的靶基因，为新生儿肺损伤的治疗寻找新策略。研究指出，初步确定了转录因子THAP1在肺泡Ⅱ型上皮细胞中的靶基因结合序列，提示THAP1广泛参与了多种生物学过程，为研究THAP1的功能及作用机制研究提供了线索，从而为新生儿肺损伤的治疗奠定了基础。该文发表在2015年第09期《南京医科大学学报（自然科学版）》杂志上。
利用THAP1抗体进行染色质免疫共沉淀实验（chromatin immuno-precipitation，Ch IP），将富集到肺泡Ⅱ型上皮细胞来源的肺腺癌细胞A549上的DNA样品进行高通量测序，对得到的核苷酸序列进行生物信息学分析。
共得到20 417个THAP1结合位点的核苷酸序列片段，对应9 688个结合的靶基因，THAP1结合的主要区域分布在基因间区、内含子区和启动子区。其中包含1 051个基因的启动子区。将THAP1结合于启动子区的基因进行基因功能（gene ontology，GO）注释，表明THAP1参与包括蛋白质二聚化、同源蛋白质结合、蛋白质磷酸化调节、类固醇激素受体的激活等多种细胞生物学过程。THAP1结合的基因主要涉及9个代谢路径，以胞吞作用、多糖降解、硫酸软骨素或硫酸皮肤素的生物合成等路径为主。
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