北大医院男科中心于2005年6月22日由北京市卫生局批准正式成立，同年9月12日正式运行。建立之初即集中了北京大学系统权威的男科学专家，高水准的起点至今发展已历经十年，男科中心一直是国内公立医院中规模最大、设备最好、业务水平最高的集医疗、教学、科研于一体的专科单位，是我国男科学学科的“排头兵”，也是我国男科学学科建设与发展的典范，得到了国内外专家和患者的认可!

十年来，北大医院男科中心累计接诊全国各地及国外患者近50万人次，门诊手术7千余例，住院和病房手术人次近万例。诊疗范围涉及性功能障碍、不育症、前列腺疾病、生殖系统感染、生殖器发育异常、性腺功能障碍、性传播疾病、男性计划生育、男性更年期综合症和生殖系肿瘤等十大类，其中以前三类患者作为主要就诊人群。中心在男科疾病外科治疗方面极具特色，率先在国内开展各种特色男科手术：阴茎起勃器(三件套/单件套)植入术治疗男性勃起功能障碍、隐匿阴茎矫形术治疗小阴茎、阴茎弯曲矫形术治疗阴茎弯曲、阴茎龟头阴茎海绵体隧道分流术治疗阴茎异常勃起、显微镜下精索静脉结扎术治疗精索静脉曲张、显微镜下输精管-附睾吻合术治疗梗阻性无精症、显微镜下输精管-输精管吻合术治疗输精管梗阻、显微镜下睾丸取精术治疗非梗阻性无精症、精囊镜手术治疗血精及高位精道梗阻、经尿道柱状水囊扩开术治疗前列腺增生症等，为北京市、全国乃至全世界的男科疾病患者提供了优质的医疗服务，也引领全国男科外科手术学的发展。

十年来，北大医院男科中心还致力于性功能障碍、男性不育症、性腺功能低下等的基础研究，共承担国家自然科学基金9项，北京市级基金2项，横向基金9项，发表SCI级论文40篇，国内核心期刊论著121篇。中心培养博士后9名，博士17名，全国各地进修医师近200名，国家级培训班学员200余名。

为促进国际国内男科学学术交流，北大医院男科中心从2005年开始，举办六届长城国际男科论坛;从2009年开始，举办5届创普健康男科论坛;从2015年始，举办首届华夏医学论坛•泌尿生殖国际会议，为国内外男科学学术交流、提高国内男科学学术水平，付出了巨大努力!同时，北大医院男科中心多位医师担任全国学术组织的领军人物：郭应禄教授担任中国工程院院士、中国医师协会泌尿外科医师分会主任委员;辛钟成教授担任中国医促会泌尿生殖分会主任委员、中国医师协会男科医师分会副主任委员;张志超教授担任中国性学会性医学分会候任主任委员。