新生隐球菌格鲁比变种、新生变种和格特隐球菌的多重聚合酶链反应鉴定
近日，上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科、同济大学环境科学与工程学院和复旦大学遗传所遗传工程国家重点实验室的研究人员共同发表论文，旨在建立一种基于核糖体基因内间隔区(IGS)的多重聚合酶链反应(PCR)，用于快速鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌。研究指出，建立的多重PCR可快速准确地鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种、AD杂合子和格特隐球菌，且优于已报道的单一引物PCR或CGB显色培养法。该文章发表在2012 年45卷12期《中华皮肤科杂志》上。
近日，上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科、同济大学环境科学与工程学院和复旦大学遗传所遗传工程国家重点实验室的研究人员共同发表论文，旨在建立一种基于核糖体基因内间隔区(IGS)的多重聚合酶链反应(PCR)，用于快速鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌。研究指出，建立的多重PCR可快速准确地鉴定新生隐球菌新生变种、格鲁比变种、AD杂合子和格特隐球菌，且优于已报道的单一引物PCR或CGB显色培养法。该文章发表在2012 年45卷12期《中华皮肤科杂志》上。
选取新生隐球菌和格特隐球菌IGS中变异度最高的Ⅰ区(IGSl)为靶点，经ClustalW2多重比对，并结合Olig06软件在不同序列位点设计针对新生隐球菌新生变种、格鲁比变种和格特隐球菌的引物用于多重PCR分析。通过51株新生隐球菌(VNⅠ-VNⅣ和VNB基因型)和41株格特隐球菌(VGⅠ-VGⅣ基因型)对该方法进行验证，并将该方法与已报道的CGB显色培养和采用特异性引物GPA1A、CLA4D和SOD1 gattii扩增格鲁比变种、新生变种和格特隐球菌的单一引物PCR方法进行比较。
基于IGS的多重PCR分析成功鉴定所有92株新生隐球菌和格特隐球菌，对其他常见致病酵母的扩增均阴性，显示所设计引物较高的特异性；已报道的基于GPA1A和CLA4D引物PCR分别在鉴定2株和1株格特隐球菌时出现假阳性结果；CGB培养基在鉴定1株格鲁比变种和1株新生变种时出现假阳性结果。上述方法在鉴定时均未出现假阴性结果。
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