测序分析确定牙周炎进展新的调控因子
Sci Rep：测序分析确定牙周炎进展新的调控因子
据保守估计，一半以上的成年人患有牙周炎，代表了一个重大的公共卫生问题。此前，我们从牙周炎患者中分离出牙龈成纤维细胞(GFs)的一个子集，称为牙周炎相关成纤维细胞(PAFs)，具有高度降解胶原的能力。
为了阐明其分子特征，我们从健康和牙周炎位点的牙龈组织中采集GFs，通过CAGE-seq分析并与FANTOM5图谱整合。
结果显示，与来自其他器官位点的成纤维细胞相比，来自健康牙龈组织的GFs显示出独特的CAGE特征模式，且其特征在于发育上重要的转录因子的特异性表达，如BARX1、PAX9、LHX8和DLX5。另外，本研究还描述了与LHX8相关的新的长链非编码RNA。
此外，我们确定了DLX5调节RUNX2转录本的长变体的表达，其在GFs中活性尤其高，但在受到牙周炎位点的GFs中则不具有活性。GFs中敲减这些因子导致细胞外基质(ECM)组分的表达改变。
总之，这些结果表明，通过其远端启动子激活DLX5和RUNX2是GFs的独特特征，且对于ECM的调控十分重要的。PAFs中这些转录因子的下调可能与其降解胶原蛋白的性质有关，可能会影响牙周炎的进程。
原始出处：
Horie M, Yamaguchi Y.Transcriptome analysis of periodontitis-associated fibroblasts by CAGE sequencing identified DLX5 and RUNX2 long variant as novel regulators involved in periodontitis. Sci Rep. 2016 Sep 20;6:33666. doi: 10.1038/srep33666.
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