既往研究表明心血管疾病与患者心脏的表观遗传改变有关,然而,心肌细胞的内源性染色质结构目前尚未阐明。近日,在国际心血管权威杂志《Circulation》上发表了一篇旨在分析评估表观遗传学在心脏发病机制中作用的研究。 本研究在压力负荷诱导心肌细胞肥大的成人心脏组织中进行全基因组染色体构象捕获(Hi-C)和DNA测序。此外,构建心脏特异性敲除CTCF(普遍存在染色质的一种结构蛋白)小鼠模型,研究CTC
既往研究表明心血管疾病与患者心脏的表观遗传改变有关,然而,心肌细胞的内源性染色质结构目前尚未阐明。近日,在国际心血管权威杂志《Circulation》上发表了一篇旨在分析评估表观遗传学在心脏发病机制中作用的研究。
本研究在压力负荷诱导心肌细胞肥大的成人心脏组织中进行全基因组染色体构象捕获(Hi-C)和DNA测序。此外,构建心脏特异性敲除CTCF(普遍存在染色质的一种结构蛋白)小鼠模型,研究CTCF蛋白在心脏染色质结构上的功能,并通过转录组分析RNA序列研究表观遗传水平。
研究结果显示,特异性敲除CTCF的小鼠会出现心力衰竭,心衰患者的心脏表达CTCF的丰度会增高。染色质的结构分析揭示了5kb内分辨率相互作用的心肌细胞基因组,可检查染色体内和染色体间的变化,并为今后的心脏表观遗传研究提供依据。心力衰竭可以导致染色质相互作用力在致病基因周围减弱。此外,压力负荷和CTCF敲除小鼠均能重塑心脏增强子间的相互作用,从而降低染色体在这些功能元件周围的相互作用。
本研究提供了一种用于心脏表观遗传研究的高分辨率的染色质结构资源,并证明广泛的染色质重塑会增加心衰的风险。
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