基因组测序解开了一个癌症医学之谜
索勒特团队，检测了可能解释这种肿瘤敏感性的这个女患者肿瘤的mTORC1通路中几个基因的突变，但没有发现任何线索。索勒特和其他计划，筛选肿瘤中TSC1突变的膀胱癌患者，以使他们可进一步的测试依维莫司以及其他靶向mTORC1的药物治疗效果。
大多数实验性抗癌药物，因为在早期临床试验中，没有达到足够比例的有效病例数，所以就不能进入市场。但是，即使在治疗试验“失败”的药物中，研究人员可能会发现少数患者的肿瘤显著地缩小。为什么大多数患者无效，而少数病例会有显效呢，这个原因是不明确的，研究人员无奈地答不出这个问题。不过，有研究人员今天报告，通过对一个与众不同患者的肿瘤全基因组测序，他们才知道给她使用对其他患者无效的实验药物，为什么她的癌症消失了。现在，用那种药物治疗这种癌症，使患者的生活质量变得更好并延长了生命，象这样的测试，可能有助于其他一些在实验室研究中有希望，而在早期临床试验中无效的抗癌药物，重新研究和使用。
位于纽约市的纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的研究人员，对1例转移性膀胱癌女性患者的情况感到困惑，她在使用了针对涉及细胞生长的mTORC1(哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1)蛋白质的一种药物依维莫司（everolimos）后，她的肿瘤消失了。试验中，这种药物对大多数患者没有疗效，所以它被放弃作为一种单独治疗膀胱癌的药物。MSKCC和位于纽约市的威尔康乃尔医学院的内科医学科学家大卫·索勒特（David Solit）说，然而，这个用依维莫司治疗的女患者，已一直无癌生存2.5年了——对这种抗化疗的癌症来说，是一个“相当满意的前所未有的结果。”
索勒特团队，检测了可能解释这种肿瘤敏感性的这个女患者肿瘤的mTORC1通路中几个基因的突变，但没有发现任何线索。为此，索勒特团队把该女患者肿瘤的1份样本，送到与他们合作的加利福尼亚大学旧金山分校的生物信息学家巴里·泰勒（Barry Taylor）的一个商业性质实验室，进行全基因组测序。
通过这个肿瘤基因组与该妇女正常的DNA的比较，研究人员发现NF2和TSC1二个基因中的突变，该实验室研究表明，这些突变也存在于mTORC1通路中。TSC1中的突变，而不是NF2中的突变，也出现在几个其他膀胱癌样本中。虽然，TSC1（结节硬化症1）一直不在科学家的侦查范围之内，不过，这个基因可能合乎事理的涉及：人们出生时具有TSC1突变，以后会发生良性肿瘤。接着，研究人员搜索了其他13个在同一药物试验失败患者中的TSC1突变。他们今天在《科学》杂志网络版上报告，4个具有TSC1突变的肿瘤缩小了，但其余9个中只有1个对药物反应有所改变。
索勒特和其他计划，筛选肿瘤中TSC1突变的膀胱癌患者，以使他们可进一步的测试依维莫司以及其他靶向mTORC1的药物治疗效果。索勒特说：“现在，我们已有一条清晰的前进道路。”而且，他认为，这同一途径可用于其他的临床试验。他说：“这将改变我们对这些异常病例的看法。”他说，虽然研究人员已经知道，某些抗癌药物只对肿瘤中有特定突变的患者有效，全基因组测序可有助于确定更多的这种基因变化
位于波士顿的马萨诸塞州总医院的何塞·巴塞尔加（José Baselga）说：“这是一篇杰出的报告。”巴塞尔加领导一个用依维莫司治疗乳腺癌的临床试验，现在打算检测患者肿瘤的TSC1突变，看看是否可以解释为什么一些患者的治疗效果会比另一些的更好。巴塞尔加说，该研究还表明，寻找药物敏感性基因，将需要检测肿瘤的更多基因，而不只是检测几个候选的基因。他说，“我们很可能必须更深入地”测定全部基因组的序列。
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