全基因组测序研究Luminal型乳腺癌的特征
ASCO 2012研究精选：全基因组测序研究Luminal型乳腺癌的特征
ASCO 2012研究精选：
背景：为了评价雌激素受体阳性乳腺癌临床特征和体细胞突变的相关性，用大规模平行测序（MPS）检测经过新辅助芳香化酶抑制剂 （AI）治疗患者的肿瘤和正常组织DNA。
方法：MPS用于来自术前来曲唑（JACS 2009: 208, 906）和Z1031临床试验（JCO 2011: 29, 2342）77个基线肿瘤活检样本，随后靶向检测其他240个来自临床试验样本的基因序列。用标准统计学方法比较突变状态和临床参数；以信号通路为基础的相关性被用来评估基因突变引起的信号扰动和对新辅助AI的反应状况之间的相互作用。
结果：18个基因显著突变，除了PIK3CA突变之外，主要是肿瘤抑制基因功能丢失性突变。其中5个基因（RUNX1、CBFP、MYH9、MLL3和SF3B1）已知和造血系统良、恶性失调有关。 临床相关分析提示TP53突变和PAM50 Lumimal B状态、高分级组织学特征、高增殖率相关；而MAP3K1功能丢失性突变和PAM50 luminal A状态、低分级组织学特征、低增殖率相关。AI治疗能较好的抑制GATA3突变患者的肿瘤增殖，提示mutGATA3可以预测内分泌反应。MAP3K1突变尤其更常见于PIK3CA的患者，提示了两者之间的协同作用。信号传导通路分析显示罕见的MAP2K4突变导致的信号通路的扰动和MAP3K1突变类似；这个发现符合逻辑，因为MAP2K4是MAP3K1的底物。lncRNA MALAT1突变驱动的信号网络模式和多个预后不佳的临床特点相关。 罕见的药物靶向激酶的突变包括两个在HER2激酶结构域上的突变。
结论：Luminal型乳腺癌的异质性源于特殊的体细胞突变模式，但是大多数可以作为药物靶标或有潜在预后价值的突变发生率很低。基因于些发现，未来的临床试验需要综合基因组测序的方法和大规模的研究。
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