多基因平行检测技术的临床应用趋势
在多基因检测技术方面，基于二代测序技术的临床样本分析逐渐成熟。韦格尔（Wagle）和加拉维（Garraway）对137个存在可靶向分子变异的癌症相关基因进行了二代深度测序研究，包含约2300个外显子、40万个碱基序列。这些基因包括已知或正在测试的分子靶点、癌基因和抑癌基因、预测和预后基因。他们尝试从石蜡标本提取基因组DNA进行分析，目前的临床分析时间为21天。研究者提出，二代测序技术在临床应用具有一定的可行性，但仍受到测试时间长、费用相对昂贵、有效药物稀少等限制。
在多基因检测技术方面，基于二代测序技术的临床样本分析逐渐成熟。
韦格尔（Wagle）和加拉维（Garraway）对137个存在可靶向分子变异的癌症相关基因进行了二代深度测序研究，包含约2300个外显子、40万个碱基序列。这些基因包括已知或正在测试的分子靶点、癌基因和抑癌基因、预测和预后基因。他们尝试从石蜡标本提取基因组DNA进行分析，目前的临床分析时间为21天。研究者提出，二代测序技术在临床应用具有一定的可行性，但仍受到测试时间长、费用相对昂贵、有效药物稀少等限制。
随着技术的进步，在不久的将来有望实现在1~2天中完成大规模平行测序多个癌症相关基因的工作，以此将患者基于可靶向驱动基因分层，实现全面个体化治疗。
二代测序技术的成熟，必然给临床样本检测带来了很多惊喜和冲击。
DFCI的詹尼（Janne）等多位肿瘤学家都指出，多基因的分子检测会给临床试验带来新的挑战。基于基因组驱动变异的临床试验设计和实施，需要更多的协作和资源整合。“分子亚型A患者接受药物A、分子亚型B患者接受药物B”的一次性评价多个药物的临床试验，已具有很大的挑战性。而如何同时评价联合靶向药物并确定联合使用剂量，如何在Ⅰ期临床试验中整合基因组学数据，这些都需要进一步的探索。
另一方面，二代深度测序技术的使用会在同一份标本发现更多的驱动变异，如何鉴定哪些突变是主要的肿瘤驱动变异，具有重要的临床意义。
同时，这种深度测序技术的使用也会更容易发现肿瘤分子变异异质性的现象。
本次大会上，格林杰（Gerlinger）等在2012年《新英格兰医学杂志》（N Engl J Med）上发表的研究多次被引用。基于二代靶向捕获测序技术，约63%~39%的分子变异在肾癌的多个区域存在瘤内异质性，并在转移灶和原发灶间存在进化中的获得性变异，各转移灶与原发灶对比存在分支进化现象。该研究指出，单次活检组织可能会低估肿瘤的基因组变异的异质性，会给个体化诊治和分子标志物分析带来挑战。特别是在肿瘤的进展转移过程中，如何检测与转移或耐药相关的新的分子变异很重要。
因而，多位专家提出在临床开展系列活检的必要性。这种系列活检，尽管目前在临床难以实施，难以被患者接受，但是随着技术的进展，特别是循环肿瘤细胞（CTC）的研究进展，将来很可能得以实现。从循环血液中高效地获得足够量的CTC，只需要7.5 ml左右的血液就能够满足获得足够量的CTC用于临床分子检测，这在不久的未来将成为可能。
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