IGEM-CNM示肺癌预后
许多研究已阐释了肺癌的病因学并改善了其治疗方式，但迄今肺癌的5年生存率仅15%。采用基因芯片技术寻找肺癌预后相关的生物标志面临很大的挑战，因为不同的研究很少报告相似的基因。台湾大学鲁（Lu）等报告，通过整合基因表达图谱和拷贝数变异，或可将基因或路径作为肺癌预后的生物标志。论文发表于《公共科学图书馆·综合》[PLoS One 2011，6（9）：e24829]。
许多研究已阐释了肺癌的病因学并改善了其治疗方式，但迄今肺癌的5年生存率仅15%。采用基因芯片技术寻找肺癌预后相关的生物标志面临很大的挑战，因为不同的研究很少报告相似的基因。台湾大学鲁（Lu）等报告，通过整合基因表达图谱(integrator gene expression map，IGEM)和拷贝数变异（copy number mutation，CNM），或可将基因或路径作为肺癌预后的生物标志。论文发表于《公共科学图书馆·综合》[PLoS One 2011，6（9）：e24829]。
研究者对基因拷贝数变异和基因表达的的基因组进行分析，以确认与肿瘤发生及非吸烟女性肺腺癌生存率相关的基因。结果为，在至少30%的样品中有频繁的基因拷贝数变异区（CNVR）的基因图谱，其变异模式与之前几个报道非常相似。进一步对位于CNVR的基因进行数据分析后发现，在肿瘤和正常组织中，有475个表达不同的基因（P<10-5)，且其可重现性在另一项研究中被证实（P =0.0034）。通过严格的皮尔森相关系数，显示了拷贝数变异与基因表达变化间的一致性。此外，路径分析揭示了肺肿瘤发生中的两个主要功能失调，即AKT介导的生存调节和细胞骨架重构，并通过三个独立队列验证了其预测生存的有效性。
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