将最先进的癌症基因组学转换为常规临床应用，需要新的转换研究平台，以筛选、验证临床相关药物靶点及相关生物标记物检验。同时必须便于从业医师广泛应用，适用于小样本肿瘤活检，患者经济负担合理，检测信息回传至治疗医师的周转时间必须较短，最长时间一般为2周。患者治疗模式中出现的此类潜在变化已经引发了诸多新挑战。首先，最近的发现深化了患者肿瘤异质性，尤其是由原发性肿瘤至转移病灶过程中出现的体细胞突变，以及在分子靶向药物对不同肿瘤部位进行治疗时，对肿瘤的混合疗效的复杂性。第二，目前，癌症基因组在病程中出现的动态变化被认为是另外一种挑战，这是因为，在病情进展或对治疗应答时，肿瘤基因伪装可能会进行持续的变化。第三，对于所有基因及基因组检测，其关键点都是肿瘤组织的定量及定性。因此，需要对监管系统进行改善。第四，尽管全基因组测序在个体化癌症治疗中具有前所未有的潜力，但当前的挑战是，如何对巨量的基因组数据进行分析，以找到相关药物靶点及药物基因组学变异体。最后，NSCLC基因分型及基因组检测的临床应用需要医疗专业人员及NSCLC患者间的跨学科协作。

　　总而言之，利用现代分子学技术，检测NSCLC(主要为肺腺癌)中出现的由酪氨酸激酶活化的功能获得性EGFR突变及ALK基因重排的方式，已在筛选不同NSCLC患者亚群进行一线治疗的常规临床实践中得到了应用，并自2009年及2011年起，分别在EGFR TKI适用患者筛选及ALK TKI适用患者筛选方面得到了应用。针对少数(< 5%)NSCLC患者亚群的多项其他分子靶向治疗方法也正处于研发过程中。与之同步进行的预测性生物标记物相关的研发与验证工作，也正被整合入此类药物的早期临床试验之中。药物研发过程及临床治疗方面出现的这种新模式变化已经为我们带来了新的希望，也为抗击肺癌战线的所有利益攸关方同时带来了诸多契机和诸多挑战。在研究领域目前正通过数种多重基因分型平台，考察效应型热点原癌基因的突变或基因扩增/重排情况，得到了积极的结果，并在广泛的临床肿瘤学实践应用中得到扩展应用。然而，仍需要通过严格的前瞻性临床评价方式，对通过基因分型途径改善NSCLC患者临床预后方面进行验证。相关技术仍在继续发展，通过具有扩展性的多重NGS技术，可实现对NSCLC个体患者肿瘤进行综合性的全基因组分子注释，这种方式在推动个体化癌症治疗方面前景广阔，可令相关治疗达到兼具疗效最大化及毒性最低化的目的。在癌症基因组中的发现向提高临床治疗方面的转化过程中，最大的挑战是从癌症患者个体特征随时间衍化的角度，对基因组畸变的生物相关性进行理解。尽管前途坎坷，但通过近期在基因组技术领域和药物研发领域的进展，及由此汹涌而至的基因组信息和各种新型药物，则令以分子为基础的个体化肺癌治疗不再仅是一个梦想。（生物谷Bioon.com）

　　文章编译自：Genotyping and Genomic Profiling of Non–Small-Cell Lung Cancer: Implications for Current and Future Therapies