Mol Med Rep：全转录调控分析为乳腺癌的治疗提供新的生物标志物
非编码RNA在调节某些基因的表达中起重要作用，并参与了乳腺癌的发生发展。绝大多数研究都集中在探究发现调控和发挥功能的非编码RNAs(lncRNAs)和微小RNAs(miRNAs/miRs)，很少有研究调查了lncRNAs和miRNAs的转录调节。 本研究中，基于TCGA数据库浸润性乳腺癌的癌基因组数据，并使用生物信息学计算方法，构建了一个lncRNA- miRNA- mRNA网络。该网络由601
非编码RNA在调节某些基因的表达中起重要作用，并参与了乳腺癌的发生发展。绝大多数研究都集中在探究发现调控和发挥功能的非编码RNAs(lncRNAs)和微小RNAs(miRNAs/miRs)，很少有研究调查了lncRNAs和miRNAs的转录调节。
本研究中，基于TCGA数据库浸润性乳腺癌的癌基因组数据，并使用生物信息学计算方法，构建了一个lncRNA- miRNA- mRNA网络。该网络由601个节点和706个边缘，代表lncRNA-、miRNA以及靶基因之间的复杂的调控网络。目前的研究表明，mir-510是最有力的miRNA，是许多靶基因的调节控制器。此外，据观察，lncRNAs PVT1、CCAT1和linc00861与临床生物标志物相互作用，包括受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2、雌激素受体和孕激素受体，且已经RNA蛋白相互作用预测软件演示证明。
总之，该研究结果表明，lncRNA-miRNA- mRNA相互作用将会行进一步的实验研究，或可用于乳腺癌的治疗中开发新的生物标志物预测。
原始出处：
Yuhan Zhang, Yongfeng Li, et al.,Identification of an lncRNA-miRNA-mRNA interaction mechanism in breast cancer based on bioinformatic analysis. Mol Med Rep. 2017 Oct; 16(4): 5113–5120. Published online 2017 Aug 21. doi: 10.3892/mmr.2017.7304
相关文章
评论
我要跟帖
.jpg)
