ASCO 2012研究精选：黑色素瘤与BRAF
ASCO 2012研究精选（更多精彩内容，请点击专题报道：http://zt.cmt.com.cn/zt/asco2012/index.html）：黑色素瘤中MicroRNA改变与BRAF状态相关MicroRNA alterations associated with BRAF status in melanoma.背景:我们假设BRAF突变导致m
ASCO 2012研究精选（更多精彩内容，请点击专题报道：http://zt.cmt.com.cn/zt/asco2012/index.html）：
MicroRNA alterations associated with BRAF status in melanoma.
背景:我们假设BRAF突变导致microrna(miRNA)改变，这种改变有助于协调突变BRAF在黑色素瘤中的致癌性效果。我们的研究第一次检查原发性黑色素瘤中BRAF突变状态与以已知肿瘤抑制因子为靶向的miRNA表达之间的关联。方法：我们对在纽约大学langone医学中心前瞻性积累的84个黑素瘤病人进行了研究。从连续的福尔马林固定石蜡包埋组织提取DNA和总RNA。DNA测序确定BRAF突变状态。RNA与包含1314探针的miRCURY miRNAmicroarrays杂交。用t-test( p<0.05) 分析标准化的miRNA数据,确定BRAFmut与BRAFwt病例之间差异表达的miRNAs。平均倍数改变(FC)>2的被选为做预测(TargetScan, PicTar)和验证(miRWalk)基因目标分析，用路径映射算法（pathway-mapping algorithms）(KEGG, BioCarta, PANTHER)分析被³2 miRNAs作为靶向的重叠基因。结果：48(57%)和36(43%)名初选分别是BRAFwt和BRAFmut(26个V600E, 4个V600K, 1个V600R, 1个V600D, 4 其他)。30 miRNAs满足统计学显著差异表达和FC阈值的标准:let-7i, miR-23c, -26a/b, -27b, -34a, -98, -126*, -141, -148a, -181b, -195, -199a-3p, -199a/b-5p, -200a/b/c, -203, -205, -455-3p, -491-3p, -606, -641, -646, -1297, -4301; miRPlus-C1070, -C1110, -G1246-3p(平均FC:2.3-3.5,与BRAFwt相比，所有的在BRAFmut中都增加)。预测和验证靶基因分析显示317基因,其中110(35%)是³2 miRNAs的会聚性目标。预测、验证和会聚性靶基因的路径分析一致指出BRAFmut相关miRNAs在已知肿瘤抑制因子FAS, PTEN, 和TNF和p53通路的潜在影响。结论：在BRAFmut vs. BRAFwt 初选患者中差异表达的miRNAs 靶向 在黑色素瘤生物学和/或治疗反应中的角色已知的基因。这些miRNAs值得作为BRAFmut肿瘤生成程序的潜在效应器进一步被研究。
相关文章
评论
我要跟帖
