非编码长链RNA LOC100130476在食管鳞癌中的表达及其甲基化状态
近期，河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理研究室研究人员发表论文，旨在检测人食管癌细胞系及食管鳞状细胞癌（esophagealsquamouscellcarcinoma，ESCC）组织中长链非编码RNA（longnon-codingRNA，lncRNA）LOC100130476的表达情况及其甲基化状态，并探讨lncRNALOC100130476在食管鳞癌发生及发展中的作用。研究指出，Ln
近期，河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理研究室研究人员发表论文，旨在检测人食管癌细胞系及食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma，ESCC）组织中长链非编码RNA（long non-coding RNA，lnc RNA）LOC100130476的表达情况及其甲基化状态，并探讨lnc RNA LOC100130476在食管鳞癌发生及发展中的作用。研究指出，Lnc RNA LOC100130476在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生和发展密切相关，其第一外显子区的甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一。该文发表在2015年第08期《肿瘤》杂志上。
分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR（methylation specific PCR，MSP）法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-aza-2’-deoxycytidine，5-Aza-d C）处理前后的食管癌细胞系TE1、TE13、T.TN和Ec109细胞中以及食管鳞癌组织及其相应癌旁正常组织中lnc RNA LOC100130476的表达情况和甲基化状态。
结果显示， 未经5-Aza-d C处理的食管癌TE1、TE13和T.TN细胞中lnc RNA LOC100130476的表达均为阴性，仅在Ec109细胞中为弱阳性表达；用5-Aza-d C处理后，TE1、TE13和T.TN细胞中lnc RNA LOC100130476均转变为阳性表达，而Ec109细胞中lnc RNA LOC100130476的表达水平也有所上调。TE1、TE13、T.TN和Ec109细胞中，在5-Aza-d C未处理前lnc RNA LOC100130476均表现为高甲基化的状态，应用5-Aza-d C处理后，Ec109细胞中lnc RNA LOC100130476甲基化程度明显降低，TE1、TE13和T.TN细胞中的lncR NA LOC100130476则均表现为非甲基化状态。LncR NA LOC100130476在食管鳞癌组织中的表达水平为0.49±0.09，明显低于癌旁正常组织的0.56±0.08（P<0.05），并与组织分化程度和TNM分期密切相关（P值均<0.05）。食管鳞癌组织中lnc RNA LOC100130476第一外显子区的甲基化率为69.44%（50/72），明显高于癌旁正常组织的26.39%（19/72）（P<0.05），并与组织分化程度和TNM分期密切相关（P值均<0.05）。发生lnc RNA LOC100130476甲基化的食管鳞癌组织中lnc RNA LOC100130476的表达量为0.47±0.08，明显低于未发生甲基化的食管鳞癌组织的0.55±0.08（P<0.05）。
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