2007—2011年青岛地区H3N2流感病毒全基因组进化特征分析
近日，汪照国、杨婷婷和柴青等人共同发表论文，旨在了解2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒的全基因组进化特征。研究指出2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒各基因片段呈现复杂的进化特征。该文章发表在2013年1月第47卷1期的《中华预防医学杂志》上。
近日，汪照国、杨婷婷和柴青等人共同发表论文，旨在了解2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒的全基因组进化特征。研究指出2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒各基因片段呈现复杂的进化特征。该文章发表在2013年1月第47卷1期的《中华预防医学杂志》上。
选取2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒58株，提取病毒RNA，应用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）扩增各基因片段，并进行序列测定；用Sequencher软件完成序列拼接。选取Genbank收录的全球同期氨基酸数大于300的H3N2流感病毒589株，以其血凝素重链区（HA1）序列作为参照，用Mega 5.O软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。
2007—2011年青岛地区流行的H3N2流感病毒血凝素（HA）基因在进化树上形成单一主干，每一流行季毒株的起源均晚于上一季；全基因组进化分析发现，2009—2010流行季存在重配病毒株，而2010—2011流行季同时存在两系毒株流行，该季病毒呈现复杂的重配现象。病毒HA1蛋白与疫苗株比较，2007—2011年各监测季分别有8、6、6、8、11处氨基酸变异，涉及13个抗原位点。M2蛋白氨基酸序列分析表明分离到的H3N2流感病毒31位氨基酸均发生丝氨酸→天冬酰胺(S31N)突变。2007—2011年青岛地区分离的H3N2流感病毒HA1基因在进化树上与全球同期H3N2流感毒株处于同一主要分支。序列比对及抗原性分析显示，毒株A/Qingdao/F521/2011存在H3N2与甲型H1N1流感病毒共感染现象。
相关文章
评论
我要跟帖
